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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 16s rDNA 扩增引物的选择
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bear0329

金虫 (正式写手)

[求助] 16s rDNA 扩增引物的选择

各位大侠，小弟是刚接触PCR，我要扩增的是16srDNA,做T-RFLP,那么在引物的选择方面选什么好点呢？因为不同的引物扩增出的片段长度会有差异，这会不会影响后面的分析呢？谢谢
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以马内利！
1楼 2011-06-07 09:22:24
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xiadongliang

金虫 (正式写手)
西瓜: 很热心。为了避免广告嫌疑，此类话题请用站内短消息交流吧。 2011-07-05 17:18:41
引用回帖:
Originally posted by 树宝宝zyx at 2011-07-05 09:44:54:
恩，你那也可以测？我问了上海基康，他们可以做的

我这儿可以做，在北京。
看你离哪儿近了，还有就是价格，48个反应以内上机可以给你600元。
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8楼2011-07-05 15:23:31
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weidandande

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
bear0329(金币+1): 很好啊，谢谢~ 2011-06-07 13:10:31
dhd997(金币+3): good 2011-06-07 16:55:11
西瓜(金币+2, EPI+1): Good！ 2011-07-05 17:17:02
个人认为，引物的选择得有以下几个方面。
1、能够较为稳定的扩增，产物单一、明亮；
2、各个引物若都符合上述要求，那么得测序得到序列后再进行分析；
3、习惯上序列长度越大，包含的信息量越多，但也不一定对自己的实验就好，总之还是得到该物种16SrDNA的长序列后，分析之，在确定使用那一对引物。16SrDNA有许多保守的引物，一开始做的话，尽量选择具有较长的PCR产物的引物
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2楼2011-06-07 11:04:04
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树宝宝zyx

新虫 (小有名气)
你好啊，我也在做T-RFLP,你如何进行荧光检测，基因扫描啊，我们学校没有仪器基因测序仪，问了几家公司只提供测序，咋办呢。。。
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科研真辛苦！
3楼2011-07-04 10:59:15
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xiadongliang

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by 树宝宝zyx at 2011-07-04 10:59:15:
你好啊，我也在做T-RFLP,你如何进行荧光检测，基因扫描啊，我们学校没有仪器基因测序仪，问了几家公司只提供测序，咋办呢。。。

引物27F  1492R
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4楼2011-07-04 14:17:45
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