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bear0329

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[求助] 16s rDNA 扩增引物的选择

各位大侠，小弟是刚接触PCR，我要扩增的是16srDNA,做T-RFLP,那么在引物的选择方面选什么好点呢？因为不同的引物扩增出的片段长度会有差异，这会不会影响后面的分析呢？谢谢

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以马内利！

1楼 2011-06-07 09:22:24

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xiadongliang

金虫 (正式写手)

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西瓜: 很热心。为了避免广告嫌疑，此类话题请用站内短消息交流吧。 2011-07-05 17:18:41

引用回帖:

Originally posted by 树宝宝zyx at 2011-07-05 09:44:54:
恩，你那也可以测？我问了上海基康，他们可以做的

我这儿可以做，在北京。
看你离哪儿近了，还有就是价格，48个反应以内上机可以给你600元。

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8楼2011-07-05 15:23:31

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weidandande

银虫 (小有名气)

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【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
bear0329(金币+1): 很好啊，谢谢~ 2011-06-07 13:10:31
dhd997(金币+3): good 2011-06-07 16:55:11
西瓜(金币+2, EPI+1): Good！ 2011-07-05 17:17:02

个人认为，引物的选择得有以下几个方面。
1、能够较为稳定的扩增，产物单一、明亮；
2、各个引物若都符合上述要求，那么得测序得到序列后再进行分析；
3、习惯上序列长度越大，包含的信息量越多，但也不一定对自己的实验就好，总之还是得到该物种16SrDNA的长序列后，分析之，在确定使用那一对引物。16SrDNA有许多保守的引物，一开始做的话，尽量选择具有较长的PCR产物的引物

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2楼2011-06-07 11:04:04

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