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swallow52u

银虫 (正式写手)

[求助] PCR的电泳结果是除了Marker能出来条带,其他都是什么都没有

我是做的RT-PCR做的细胞的,在提取完RNA后我做了电泳和浓度测定,结果都还不错。也顺利的反转录成了CDNA,在做β-actin的PCR时,结果很好,条带也比较清楚。我还做了两遍,先是做了正常对照组的,接着跑了所有样本的β-actin,所有样都出来了,但我现在已经重复不出来了,条件设置的都一样!我也思考了下原因,可能是CDNA降解了?或者是引物污染了?我只能想到这么多啊?请各位高手帮帮我啊,我的实验该怎样改进?谢谢了?现在的PCR的电泳结果是除了Marker能出来条带,其他都是什么都没有。愁死我了啊!
我的PCR体系是
PCR步骤: 20ul体系
MIX        10uL
cDNA        1 uL        
引物上游        1 uL,        
引物下游        1 uL
DEPC H2O        补足20ul        
加样的顺序也是这样的,不知道合适不?
PCR上机设置温度:
处理        温度        时间
预变性        94℃        5min
变性        94℃        30s
退火        根据说明上下浮动2℃        45s
延伸        72℃        30s
循环        35 从第2个开始        45s/个
延伸        72        7min
        4℃        Forever

[ Last edited by 1949stone on 2011-5-20 at 17:59 ]
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我要我的幸福,谁也夺不走!
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tongyanna

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

swallow52u(金币+1): 2011-05-21 00:38:35
swallow52u(金币+1): 2011-05-22 10:42:11
swallow52u(金币+1): 2011-05-24 15:32:05
MIX每次用的时候要混匀;加样后也要混匀;模版降解是个问题,每次吸取模板时稍微吹打下;引物方面降解可能性稍小点;每次加样可以放冰上,尝试下!反应体系只要你以前出来过,应该问题不大,模版可以考虑重做,引物若有降解,在电泳时能看出来的啊!
自己的路,自己快乐的走
10楼2011-05-20 18:03:34
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查看全部 10 个回答

swallow52u

银虫 (正式写手)

★ ★ ★ ★ ★
dhd997(金币+5, EPI+1): good 2011-05-20 08:29:27
dhd997(EPI-1): 暂时撤回。确实有用在补加 2011-05-20 11:03:08
我的PCR体系是
PCR步骤: 20ul体系
MIX        10uL
cDNA        1 uL        
引物上游        1 uL,        
引物下游        1 uL
DEPC H2O        补足20ul        
加样的顺序也是这样的,不知道合适不?
PCR上机设置温度:
处理        温度        时间
预变性        94℃        5min
变性        94℃        30s
退火        根据说明上下浮动2℃        45s
延伸        72℃        30s
循环        35 从第2个开始        45s/个
延伸        72        7min
        4℃        Forever
我要我的幸福,谁也夺不走!
2楼2011-05-20 01:55:39
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路人甲007

木虫 (正式写手)

小七

★ ★
dhd997(金币+2): 可能是我粗心,您是否有更好的见解? 2011-05-20 11:03:43
这个加分和EPI给的很莫名其妙啊  不知道版主怎么给的
与人玫瑰手有余香
3楼2011-05-20 10:04:07
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zhaohq1209

铁杆木虫 (著名写手)

dhd997: 可能是我粗心,您是否有更好的见解? 2011-05-20 11:03:53
引用回帖:
Originally posted by swallow52u at 2011-05-20 01:55:39:
我的PCR体系是
PCR步骤: 20ul体系
MIX        10uL
cDNA        1 uL        
引物上游        1 uL,        
引物下游        1 uL
DEPC H2O        补足20ul        
加样的顺序也是这样的,不知道合适 ...

这样也给金币和EPI,版版粗心了吧?
我有一个梦想,我梦想有一天,我们的人民可以根据自己的意愿与消费能力,居住在自己愿意居住的地方。
4楼2011-05-20 10:08:54
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