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jia1012428

铜虫 (小有名气)

[求助] 蛋白纯化一个很挠头的问题,请高手指教!

1.用离子交换柱做纯化,上样后洗脱未被柱子结合的蛋白,总能洗下来一个尖峰,而在拉Nacl溶液梯度的时候,也能洗脱下的几个峰,但这些峰都没有酶活。
2.后来增大了上样量,还是这种情况,只不过每个峰都高和宽一些,更重要的是,在洗脱未被结合的蛋白的峰那里测到了酶活。
请问我的这种情况是不是书上说的柱子只结合杂蛋白,而不结合目的蛋白?
另外,1中测不到目的峰的酶活是不是因为蛋白太稀了,酶活检测不到;2中洗脱未结合的目的峰有发酵液色素的颜色,是不是上样量太大了,都没吸附到柱子上啊,所以才有酶活?
请高手指点!
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冼亮淀粉酶

专家顾问 (知名作家)

生物大分子降解酶

【答案】应助回帖

。。。。。。。。。。。
流星来时我许了个愿,愿我有吃有喝还有舒服的猪圈。讨厌发帖前不搜索论坛重复发帖和仅把论坛当解决问题工具,久不看论坛一来就提问者,宁弃EPI和VIP也不回帖。
2楼2011-05-15 00:09:51
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冼亮淀粉酶

专家顾问 (知名作家)

生物大分子降解酶

【答案】应助回帖

jia1012428(金币+2): 专业,不用再说明! 2011-05-15 23:11:13
silicare(EPI+1): 2011-05-16 08:40:04
引用回帖:
Originally posted by 冼亮淀粉酶 at 2011-05-15 00:09:51:
。。。。。。。。。。。

你想要的蛋白质等电点可能是多少,上样缓冲液的pH值是多少?如果是阳离子柱,那么蛋白质等电点要比上样缓冲液的pH值高;如果是阴离子柱,那么蛋白质等电点要比上样缓冲液的pH值低。而且要有一个pH值的差别才好吸附。

无论是阴还是阳,吸附的时候都要保持低盐,如果蛋白质等电点和上样缓冲液的pH值相差不大,那么一点儿盐就能解吸附,你要的蛋白质就只会在穿透液中。

下面传一张图片,AKTA的,你可以看A280曲线,穿透液里有很多蛋白质。

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3楼2011-05-15 00:11:18
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jia1012428

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by 冼亮淀粉酶 at 2011-05-15 00:11:18:
你想要的蛋白质等电点可能是多少,上样缓冲液的pH值是多少?如果是阳离子柱,那么蛋白质等电点要比上样缓冲液的pH值高;如果是阴离子柱,那么蛋白质等电点要比上样缓冲液的pH值低。而且要有一个pH值的差别才好 ...

哥们,咱俩的图差不多啊,我用的阴离子交换柱。这也算纯化蛋白了把,但是我感觉第二次上样量太大了,洗脱未结合的蛋白时下来的液体有色素的颜色,是不是需要减少上样量啊。



4楼2011-05-15 22:52:41
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jia1012428

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by 冼亮淀粉酶 at 2011-05-15 00:11:18:
你想要的蛋白质等电点可能是多少,上样缓冲液的pH值是多少?如果是阳离子柱,那么蛋白质等电点要比上样缓冲液的pH值高;如果是阴离子柱,那么蛋白质等电点要比上样缓冲液的pH值低。而且要有一个pH值的差别才好 ...

你这个洗下来的蛋白浓度挺高啊,你用的是多大柱体积的柱子,我的柱体积是20mL!
5楼2011-05-15 22:58:00
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冼亮淀粉酶

专家顾问 (知名作家)

生物大分子降解酶

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
silicare(金币+5): 鼓励交流 2011-05-16 08:40:18
1、你用了阴离子柱,确实是在纯化蛋白质,毫无置疑。
2、我的柱床体积也是20毫升,但这跟穿透液有没有酶活力没有关系。
3、你第一次上样时候穿透液的蛋白质峰达到550mau,第二次达到1400mau,是第一次的两倍多;第一次三次不连续梯度洗脱中最高峰为350mau,第二次为500mau。确实是上样量加大了。
4、总有些色素是不会被层析柱吸附的,也总有一些是被吸附的,这与色素的性质有关,与层析柱的吸附能力无关。
5、细碎线为电导率,最终的电导率约为85%,是不是用1M的氯化钠?两次穿透液中都有5-7%的电导率,说明你除盐除得不够干净,又或者你用来除盐的溶液本身的电导率就较大,所以很多蛋白质都不被吸附,建议你除盐干净一些,这样的要的蛋白质可能就能吸附了。
6、如果还不能吸附,那么可能是你的蛋白质等电点与起始缓冲液的pH值差不多,就要改变起始缓冲液的pH值。
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6楼2011-05-16 00:09:24
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jia1012428

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by 冼亮淀粉酶 at 2011-05-16 00:09:24:
1、你用了阴离子柱,确实是在纯化蛋白质,毫无置疑。
2、我的柱床体积也是20毫升,但这跟穿透液有没有酶活力没有关系。
3、你第一次上样时候穿透液的蛋白质峰达到550mau,第二次达到1400mau,是第一次的两倍多; ...

我是直接将发酵液浓缩后透析的,没有用硫胺沉淀,所以盐离子浓度的问题不一定是主要问题。我跑个SDS-PAGE看看蛋白条带怎么样吧,如果很纯的话,就这样弄好了,很方便,不一定非要目的蛋白挂到柱子上,你说呢?
7楼2011-05-16 08:32:34
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冼亮淀粉酶

专家顾问 (知名作家)

生物大分子降解酶

是的,目标蛋白质流穿也是有好处的,去试试吧。不过如果还是不纯的话,就推荐除盐干净一些,我是不喜欢色素的,为了除色素我也曾经死过不少脑细胞了。
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8楼2011-05-16 16:27:10
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