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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 综合其他 » 【求助】请教生物信息学方面的专家，一个进化树构建的问题？
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pengxin8086

铁杆木虫 (著名写手)

[交流] 【求助】请教生物信息学方面的专家，一个进化树构建的问题？

各位高手，请问我如果知道一组蛋白质序列之间的相似性矩阵，怎么用mega或者phylip软件构建这组蛋白质的进化树？谢谢了！
如下面的这个例子，如果我知道9个不同物质ND5蛋白质序列的相似性矩阵（即距离矩阵），我怎么用MEGA或者PHYLIP软件中（NJ method or UPGMA method）来构建这个进化树。那位专家，如果曾经做过这方面的研究，可以交流一下。我看有好多的文献都用这个方法，但是由于自己没有系统的学习过这方面的知识，都是凭自己看资料或者书籍才慢慢了解的，所以对于这两个软件不是很了解。故在此请教各位高手，先谢谢了！


[ Last edited by pengxin8086 on 2011-4-11 at 22:18 ]
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1楼 2011-04-11 22:16:57
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xp198766

铁杆木虫 (著名写手)
一般不是用相似度文件建树吧，一般是用序列建树的，这些我想要建的话也是建距离树吧，也不太懂……
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6楼2011-04-12 10:31:26
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