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zhuifeng7000

至尊木虫 (著名写手)

[求助] 求助:做进化树问题 已有2人参与

在基因组上有3个紧密排列的基因A、B、C,这3个紧密排列的基因在菌株1、2、3、4、5中都存在,请问能不能做这3个基因在这5株菌中的进化树?
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
zhuifeng7000: 金币+5, ★★★很有帮助 2014-04-15 09:10:17
kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2014-04-16 08:59:48
一般根据基因树做物种树时,为使基因树尽可能接近物种树,基因选择依据是选取多个相对独立的基因建树,你的这三个基因紧邻并不相互独立,所以有可能建的树和实际有较大偏差。你可以分别以三个基因建树,看下结果是否一致,如果一致暂且用它代表物种树,如不一致,那就需要再增加其他基因建树。
2楼2014-04-14 23:28:32
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zhuifeng7000

至尊木虫 (著名写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by stone2239 at 2014-04-14 23:28:32
一般根据基因树做物种树时,为使基因树尽可能接近物种树,基因选择依据是选取多个相对独立的基因建树,你的这三个基因紧邻并不相互独立,所以有可能建的树和实际有较大偏差。你可以分别以三个基因建树,看下结果是否 ...

好的,谢谢~还有一个问题是如果我想说明这3个紧密排列的基因在一个门的很多菌株里面都是存在的,我是否可以通过进化树来说明这个问题呢?
3楼2014-04-15 09:12:39
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yuren2009

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
zhuifeng7000: 金币+5, ★★★很有帮助, 能不能发过来看一下? 2014-04-15 12:05:26
kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2014-04-16 08:59:53
有文献里做进化树就用的多基因联合
学习使你立于不败之地
4楼2014-04-15 10:03:52
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yuren2009

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
zhuifeng7000: 金币+5, ★★★很有帮助, 谢谢 2014-04-15 13:59:34
kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2014-04-16 08:59:58
学习使你立于不败之地
5楼2014-04-15 13:32:28
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by zhuifeng7000 at 2014-04-15 09:12:39
好的,谢谢~还有一个问题是如果我想说明这3个紧密排列的基因在一个门的很多菌株里面都是存在的,我是否可以通过进化树来说明这个问题呢?...

这个不了解
6楼2014-04-16 11:26:28
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