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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 求助：做进化树问题
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zhuifeng7000

至尊木虫 (著名写手)

[求助] 求助：做进化树问题 已有2人参与

在基因组上有3个紧密排列的基因A、B、C，这3个紧密排列的基因在菌株1、2、3、4、5中都存在，请问能不能做这3个基因在这5株菌中的进化树？
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1楼 2014-04-14 22:49:42
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
zhuifeng7000: 金币+5, ★★★很有帮助 2014-04-15 09:10:17
kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2014-04-16 08:59:48
一般根据基因树做物种树时，为使基因树尽可能接近物种树，基因选择依据是选取多个相对独立的基因建树，你的这三个基因紧邻并不相互独立，所以有可能建的树和实际有较大偏差。你可以分别以三个基因建树，看下结果是否一致，如果一致暂且用它代表物种树，如不一致，那就需要再增加其他基因建树。
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2楼2014-04-14 23:28:32
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zhuifeng7000

至尊木虫 (著名写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by stone2239 at 2014-04-14 23:28:32
一般根据基因树做物种树时，为使基因树尽可能接近物种树，基因选择依据是选取多个相对独立的基因建树，你的这三个基因紧邻并不相互独立，所以有可能建的树和实际有较大偏差。你可以分别以三个基因建树，看下结果是否 ...

好的，谢谢~还有一个问题是如果我想说明这3个紧密排列的基因在一个门的很多菌株里面都是存在的，我是否可以通过进化树来说明这个问题呢？
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3楼2014-04-15 09:12:39
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yuren2009

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
zhuifeng7000: 金币+5, ★★★很有帮助, 能不能发过来看一下？ 2014-04-15 12:05:26
kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2014-04-16 08:59:53
有文献里做进化树就用的多基因联合
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学习使你立于不败之地
4楼2014-04-15 10:03:52
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yuren2009

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
zhuifeng7000: 金币+5, ★★★很有帮助, 谢谢 2014-04-15 13:59:34
kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2014-04-16 08:59:58
你可以参考下：http://www.cnki.com.cn/Article/CJFDTotal-FJLB201302016.htm
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学习使你立于不败之地
5楼2014-04-15 13:32:28
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by zhuifeng7000 at 2014-04-15 09:12:39
好的，谢谢~还有一个问题是如果我想说明这3个紧密排列的基因在一个门的很多菌株里面都是存在的，我是否可以通过进化树来说明这个问题呢？...

这个不了解
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6楼2014-04-16 11:26:28
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