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kakaqa

铜虫 (初入文坛)


[交流] 【求助/交流】请教3000bp的条带的连接问题

我克隆基因扩增得到了一个3000bp的片段,现在问题来了,我们实验室只有pMD18-T这种载体,听说这种载体连接3000bp的片段有点难度,但也能连上,请教用这种载体连过3000bp条带的高手,连接体系是怎样的,多少度需要连接多久,我已经做了3次了,结果都是失败,相当的郁闷啊!!!
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jackiechubut

木虫 (小有名气)


2200左右的倒是连过,不过没用这个T载体,实在连不上你可以考虑购买其他的T载体连接下。
2楼2010-11-11 21:10:53
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lvbobo823

铁杆木虫 (正式写手)



amisking(金币+1):鼓励交流! 2010-11-11 21:45:09
3kb有点大,你是用普通TAQ做的吗?最好用高保真酶把产物纯化后再加普通TAQ跟dNTPs 72度半小时,再连pMD18-T 16度反应五六个小时。我实验室有这么做的结果不错。希望你成功。
3楼2010-11-11 21:16:30
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kakaqa

铜虫 (初入文坛)


引用回帖:
Originally posted by lvbobo823 at 2010-11-11 21:16:30:
3kb有点大,你是用普通TAQ做的吗?最好用高保真酶把产物纯化后再加普通TAQ跟dNTPs 72度半小时,再连pMD18-T 16度反应五六个小时。我实验室有这么做的结果不错。希望你成功。

我是用TAKARA的EXtaq做的,连了好多次都连不上,回收的条带很亮,但就是连接不上,真是郁闷死了,我是连接过夜的,现在又做了一次,希望能成功。哎,没办法,就碰运气了,载体本身只有2.7kb,希望这次运气不错。
4楼2010-11-12 08:18:07
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yzuxhq368

金虫 (小有名气)



dhd997(金币+1):鼓励交流。 2010-11-12 20:25:52
其实不用过夜连。按说明书上的温度,延长几个小时,连接效率很高。我连的是pMD18-T  simple,3000多的片段。
5楼2010-11-12 20:06:36
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kakaqa

铜虫 (初入文坛)


引用回帖:
Originally posted by yzuxhq368 at 2010-11-12 20:06:36:
其实不用过夜连。按说明书上的温度,延长几个小时,连接效率很高。我连的是pMD18-T  simple,3000多的片段。

请问你是16度连的吗。还有载体和插入片段各加了多少微升,谢谢。
6楼2010-11-13 21:17:13
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yzuxhq368

金虫 (小有名气)


有段时间了,反正是按说明书上的用量和温度,时间记不得了,可能有7-8小时。不过片段浓度和纯度都是用nanodrop测过的,挺好的。260/280在1.8-1.9之间,浓度大概在200左右。
7楼2010-11-13 21:53:17
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yzuxhq368

金虫 (小有名气)


我用的是takara的pMD18T-Simple,载体存放时间也挺长的,用剩的一点点,好像载体用了一微升,solution 1用了5微升,片段加了4微升?
8楼2010-11-13 21:59:15
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zgb1982

木虫 (正式写手)


单纯从连接上讲,不算难连吧,我连过4.3Kb的,4度过夜,10ul体系,测序了,不过存在突变位点。
9楼2010-11-13 22:06:53
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zhangxn2010

木虫 (著名写手)


用的solutin1还是T4连接酶啊?条件要最佳
10楼2010-11-13 22:10:24
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glannee

铁杆木虫 (正式写手)


★ ★ ★
scelab(金币+3):热心虫友,欢迎多来交流~~~:tiger06::tiger28::tiger23: 2010-11-13 23:51:49
kakaqa(金币+5):恩,好的,我再试试。 2010-11-14 12:33:25
我最大连过6.5k的片段,2次操作就连上了,没有问题。用的是takara的pMD18T-Simple,10微升体系,16℃10小时(或者过夜)。片段浓度大概是100-150ng,基本就按说明书的量操作,
载体用了1微升,
solution 1用了5微升,
片段加了4微升
11楼2010-11-13 22:53:25
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虫子火箭兵

金虫 (正式写手)



小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by kakaqa at 2010-11-12 08:18:07:



我是用TAKARA的EXtaq做的,连了好多次都连不上,回收的条带很亮,但就是连接不上,真是郁闷死了,我是连接过夜的,现在又做了一次,希望能成功。哎,没办法,就碰运气了,载体本身只有2.7kb,希望这次运气不 ...

放4度过夜试试,我们这有这么连上的,用的载体和酶与你的一样
12楼2010-11-14 18:08:13
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虫子火箭兵

金虫 (正式写手)


引用回帖:
Originally posted by 虫子火箭兵 at 2010-11-14 18:08:13:

放4度过夜试试,我们这有这么连上的,用的载体和酶与你的一样

还有,你加连接产物和载体的时候,最好先定个量,然后按说明书中的比例加
13楼2010-11-14 18:09:17
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898763077

铜虫 (初入文坛)



小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
其实不用过夜连。按说明书上的温度,延长几个小时,连接效率很高。我连的是pMD18-T  simple,3000多的片段。
本文来自: 小木虫论坛 http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=2585526&fpage=1
14楼2010-11-14 18:20:13
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yzuxhq368

金虫 (小有名气)



小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
T载体不用T4连接的。TAKARA的T载体酶和buffer都是自带的
15楼2010-11-14 19:27:18
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pushizi

木虫 (小有名气)


这个跟你的基因也有关系的,要是二级结构复杂就难办了
我们实验室一直都用1:3-1:5(摩尔比),4000 bp多的都有连上的,但是有时3kb的也有连不上,送测序都测得费劲,只要你没遇上那种基因,一般连个2小时,转化时感受态效率高点就没事,祝你成功
16楼2010-11-14 22:43:12
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