【求助】Autodock能对接含有金属原子的配体么？ - 分子模拟 - DS/Sybyl/Autodock - 小木虫论坛-学术科研互动平台

版块导航: 正在加载中...

客户端APP下载

登录注册

应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜

当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

roger0314

禁虫 (小有名气)

本帖内容被屏蔽

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

分子对接问题锦集

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

Autodock蛋白处理时，保留在蛋白的原配体如何处理？已经有12人回复
在autodock软件中如何将配体和受体拆分开已经有9人回复
autodock对接的氢键已经有7人回复
autodock柔性对接已经有5人回复
autodock的结合能是只能横向比较吗？已经有12人回复
Autodock对接构象准确性的评价——RMSD 已经有10人回复
AutoDock怎么分析大分子与小分子之间的结合能已经有7人回复
有没有人做过基于配体的虚筛的？已经有3人回复
用autodock对接，用什么软件定点突变蛋白质已经有14人回复
autodock 对接结果的合并已经有4人回复
autodock对接时蛋白的处理问题已经有6人回复
配体结构中有B原子，怎么用autodock做对接？已经有8人回复
分子对接前，含有配体的复合蛋白怎么处理？HETATM开头的元素要删除吗已经有9人回复
autodock对接怎样添加杂原子铜呢？已经有5人回复
用autodock做对接，box设置无法包括受体活性区域和配体已经有6人回复
Autodock结果，配体出现明显折叠已经有3人回复
Autodock时 gridbox的参数怎么设置?? 已经有18人回复
用AutoDock对接的结合能较小，可能是什么原因？已经有7人回复
Autodock对接构象有问题，请教已经有7人回复
【求助】求助：怎样将Autodock做出来的对接图保存成pdb格式？谢谢已经有12人回复
【求助】能够计算结合自由能的分子对接软件除了autodock还有哪些？已经有7人回复
【求助】Autodock的配体处理求助？已经有3人回复

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴

1楼 2010-11-10 12:06:24

已阅关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

autodockytu

捐助贵宾 (小有名气)

应助: 46 (小学生)
金币: 163.8
帖子: 201
在线: 39.1小时
虫号: 1792292

★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖

可以呀，增加相关金属离子参数即可

9楼2014-06-09 17:01:11

已阅关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

查看全部 15 个回答

绿茶QJM

银虫 (小有名气)

应助: 0 (幼儿园)
金币: 449.7
帖子: 236
在线: 60.4小时
虫号: 839743

★
ghcacj(金币+1):谢谢 2010-11-12 13:02:55
roger0314(金币+1): 2010-11-13 09:23:59

听说可以改角本，把金属离子改下，再对接，具体如何做不知道

赞一下(1人)

2楼2010-11-12 10:04:36

已阅关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

caixin5120

木虫 (正式写手)

模拟EPI: 1
应助: 46 (小学生)
金币: 5.9
帖子: 483
在线: 158.3小时
虫号: 576460

★ ★
ghcacj(金币+2):谢谢 2010-12-10 10:43:41

完全可以！没有任何问题：）放心去做吧！如果你的金属与你要对接的活性位点较远可以删除，如果金属就在活性位点的区域，就连金属离子一起对接！

赞一下(2人)

3楼2010-12-10 01:21:02

已阅关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

chemozhang

木虫 (正式写手)

模拟EPI: 1
应助: 3 (幼儿园)
金币: 3430.1
帖子: 615
在线: 356小时
虫号: 282954

帖子真精彩!
已经收录到淘贴专辑《分子对接问题锦集》

4楼2011-09-05 20:01:01

已阅关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

查看全部 15 个回答