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铁虫 (初入文坛)

[求助] Autodock结果，配体出现明显折叠

如题，我在看autodock的对接结果的时候发现结果中配体出现明显的折叠。
这样的结果可靠么？
求各位大侠教导教导～

1楼 2011-10-13 22:12:43

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铜虫 (正式写手)

折叠？？？为什么使用这个词？？

2楼2011-10-16 21:17:19

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铁虫 (初入文坛)

引用回帖:

2楼: Originally posted by xd200620940 at 2011-10-16 21:17:19:
折叠？？？为什么使用这个词？？

因为就是我的小分子在结合结果图中与原来的结构不一样。会有部分区域偏离了原来的位置

3楼2011-10-17 17:22:47

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铜虫 (正式写手)

★ ★
zh1987hs(金币+2): 是这样的 2011-10-17 18:30:50
wqx1990(金币+1): 谢谢。。。我再去看看下。谢谢啦~ 2011-10-19 22:30:45

引用回帖:

3楼: Originally posted by wqx1990 at 2011-10-17 17:22:47:
因为就是我的小分子在结合结果图中与原来的结构不一样。会有部分区域偏离了原来的位置

正常。小分子在对接的时候是采用柔性处理，搜索其能量最低构象。具体的你仔细看看手册，理解其对接原理吧。

4楼2011-10-17 18:05:40

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