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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 【求助】Autodock能对接含有金属原子的配体么？
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roger0314

禁虫 (小有名气)
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1楼 2010-11-10 12:06:24
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autodockytu

捐助贵宾 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
11楼: Originally posted by 坏猫懒懒 at 2014-10-28 20:35:11
同问，怎么添加相关金属参数呀，是在AD4.1_bound.dat文件中修改吗？...

是的，增加相关金属离子参数一行，然后运行Autogrid和autodock
赞一下 回复此楼
12楼2014-10-28 22:14:23
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绿茶QJM

银虫 (小有名气)
★
ghcacj(金币+1):谢谢 2010-11-12 13:02:55
roger0314(金币+1): 2010-11-13 09:23:59
听说可以改角本，把金属离子改下，再对接，具体如何做不知道
赞一下(1人) 回复此楼
2楼2010-11-12 10:04:36
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caixin5120

木虫 (正式写手)
★ ★
ghcacj(金币+2):谢谢 2010-12-10 10:43:41
完全可以！ 没有任何问题：） 放心去做吧！ 如果你的金属与你要对接的活性位点较远 可以删除，如果金属就在活性位点的区域，就连金属离子一起对接！
赞一下(2人) 回复此楼
3楼2010-12-10 01:21:02
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chemozhang

木虫 (正式写手)
帖子真精彩!
已经收录到淘贴专辑《分子对接问题锦集》
赞一下 回复此楼
4楼2011-09-05 20:01:01
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