| 查看: 1298 | 回复: 8 | |||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | |||
oyljw至尊木虫 (职业作家)
格物致知Professional
|
[交流]
【求助】怎样固定某个分子（不优化）优化其它分子 ？
|
||
|
请问： 想优化两个分子之间的相互作用，能把某个分子固 定住（不优化）先优化另一个分子吗？这是冻结核吗？ 想固定优化，需要把坐标后面加上0，还需不需要其他的？ |
回复此楼» 猜你喜欢
分子动力学 Plumed教程求助
已经有0人回复
-
研究生学术新锐奖｜宁波微纳材料研讨会参会通知
已经有2人回复
-
物理化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有208人回复
-
申请2027年材料/化学类博士
已经有6人回复
-
面上再次挂了，太难了，躺也躺不了，倦也卷不过，小学校之殇！
已经有37人回复
-
求相关合成条件
已经有12人回复
-
2027春季申博自荐
已经有6人回复
-
青基的材料青椒们，可以把硕士联培生送我这里，要研二男生
已经有63人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 高斯view怎么样固定分子的对称性进行优化？
已经有15人回复
- 构象搜索与能量优化有什么区别
已经有5人回复
- 菜鸟求助，老师给了一个分子让优化，可总是错误，求大神指点
已经有22人回复
- 高斯分子优化及频率计算
已经有4人回复
- 如何能在优化后得到这样一个分子模型
已经有5人回复
- 求助：请问各位高手在高斯09中优化单个分子时如何把一部分的参数固定了，优化其他部分
已经有12人回复
- 分子优化总是出错，请大家帮忙
已经有9人回复
- 高斯优化构建的小分子，为什么每次优化后的坐标不完全相同？
已经有8人回复
- 高斯计算中固定部分角度作优化
已经有10人回复
- 怎么利用chembio3D优化自己画的配体分子，求详细步骤
已经有8人回复
- vasp表面和吸附分子的结构分别优化后，如何将它们放到一起
已经有11人回复
- 如何让高斯在优化结构时保持其中某个单键不变
已经有7人回复
- 确定分子点群之后，优化得到的分子点群为什么还是会变
已经有4人回复
- 如何用高斯分析分子势能在某个振动模式下的分布
已经有3人回复
- 求助如何固定原子坐标进行优化，快搞疯了
已经有16人回复
- 求助关于水分子优化后的键长键角
已经有3人回复
- 如何 用高斯 固定部分原子 进行优化
已经有4人回复
- 求问一般优化小分子结构用什么方法和机组
已经有10人回复
- 高斯对多分子体系的构型优化
已经有4人回复
- 【求助】键长键角等固定后的优化..悬赏30...【已经解决～感谢～】
已经有22人回复
- 【求助】请教有关应用高斯软件优化分子结构时的问题
已经有6人回复
- 【求助】请问Gaussian在优化过程中可以固定某两个分子不动吗？
已经有8人回复
- 【求助】如何固定某几个原子不动？
已经有20人回复
oyljw
至尊木虫 (职业作家)
格物致知Professional
- 应助: 10 (幼儿园)
- 金币: 16606.1
- 散金: 120
- 红花: 27
- 帖子: 3191
- 在线: 1025.3小时
- 虫号: 482354
- 注册: 2007-12-22
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
|
我看到版主的帖子了 “（3.2） 想固定某部分原子（键长、键角、二面角、相对位置、相对方向。。。。）怎么做？ Quote: 1.opt=modredundant 命令 在坐标后面写上你要固定的原子序号，例如 1 2 f，限制1-2原子间键长 1 2 3 4 f，限制1-2-3-4原子间二面角 2.使用constants指定，如下例可以固定水的键角105.4度 O H1 O R H2 O R H1 A Variables: R 1.0 Constants: A 105.4 3.使用列标记，把直角坐标下的第二列改为-1，则会固定原子坐标， 改为比-1还小的数值，这些被改动的原子间的相对位置固定。 ” 感谢版主和楼上的！ |
5楼2010-10-26 11:13:42
2楼2010-10-25 13:21:46
oyljw
至尊木虫 (职业作家)
格物致知Professional
- 应助: 10 (幼儿园)
- 金币: 16606.1
- 散金: 120
- 红花: 27
- 帖子: 3191
- 在线: 1025.3小时
- 虫号: 482354
- 注册: 2007-12-22
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
3楼2010-10-25 18:37:08
4楼2010-10-25 18:45:53
投票:
