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【求助】请教有关应用高斯软件优化分子结构时的问题
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zhyang8385
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【求助】请教有关应用高斯软件优化分子结构时的问题
请问,在用高斯软件优化分子结构时,没有一次性完成运算,暂停后退出。下次再调用上次保存的GJF文件继续运算,所得到的结果与一次性完成的有差异吗?另外,应用Gaussian03 W软件,选择DFT/STO-3G基组2次优化预优化后红曲红素的模型(如图),以最终得到稳定构象,大概要多少时间呢?
欢迎各位高手指点,小弟感激涕零
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2010-12-22 16:16:26
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fatpig8832
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zhyang8385(金币+1): 2010-12-23 12:29:12
zhyang8385(金币+1): 2010-12-30 22:30:29
1. 调用上次保存的gjf文件是不是指重新开始算啊?如果是接着上次断掉的地方算应该是没区别的...
2. 要算多久取决于你的机器配置...看这分子的样子,估计要个几天吧...
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2010-12-22 16:32:18
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manson1998
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zhyang8385(金币+1): 2010-12-25 12:35:32
STO-3G is not reliable.
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2010-12-22 17:03:49
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zpppanda111
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zhyang8385(金币+1): 2010-12-30 22:30:37
用DFT计算很快,看你的机子情况,你可以换个中等的基组,如6-31g(d,p), STO-3G现在基本不用,不会耗时太多
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2010-12-22 22:08:20
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zhyang8385
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Originally posted by
fatpig8832
at 2010-12-22 16:32:18:
1. 调用上次保存的gjf文件是不是指重新开始算啊?如果是接着上次断掉的地方算应该是没区别的...
2. 要算多久取决于你的机器配置...看这分子的样子,估计要个几天吧...
哦,谢谢。我调用上次保存的gjf文件,是以上次断掉时软件自身保存gjf文件接着算的。我的电脑配置CPU:AMD4200+,内存1G,一次优化分两次运算,一共花了9个多小时。
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5楼
2010-12-23 12:28:49
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zhyang8385
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Originally posted by
zpppanda111
at 2010-12-22 22:08:20:
用DFT计算很快,看你的机子情况,你可以换个中等的基组,如6-31g(d,p), STO-3G现在基本不用,不会耗时太多
哦,谢谢。我采用 STO-3G是想按照文献的说明,优化下结构,验证下是否与文献给出的结构一致。
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6楼
2010-12-23 12:32:15
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tengyun1989
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试试6-31基组吧
[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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7楼
2014-04-09 18:48:44
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