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求助:请问各位高手在高斯09中优化单个分子时如何把一部分的参数固定了,优化其他部分
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求助:请问各位高手在高斯09中优化单个分子时如何把一部分的参数固定了,优化其他部分
已有3人参与
请问各位高手在高斯09中优化单个分子时如何把一部分的参数固定了,优化其他部分,也就是建一个刚性结构,在高斯中如何操作,非常感谢!
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2014-01-14 13:00:21
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2014-01-14 16:07:42
如果这个片段要参与优化,可用opt=modredundant;
如果这个片段不参与优化,可用opt=readfreeze;
还可以通过ONIOM分层的方式来做。
具体适用方法请翻阅高斯手册
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2楼
2014-01-14 13:17:35
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枪下游魂
at 2014-01-14 13:17:35
如果这个片段要参与优化,可用opt=modredundant;
如果这个片段不参与优化,可用opt=readfreeze;
还可以通过ONIOM分层的方式来做。
具体适用方法请翻阅高斯手册
那我如何在GASSION VIEWER中固定那些片段
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3楼
2014-01-14 13:42:10
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跃龙门的鱼
at 2014-01-14 13:42:10
那我如何在GASSION VIEWER中固定那些片段...
可直接在gjf文件里面固定,GV里没试过
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4楼
2014-01-14 13:44:21
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枪下游魂
at 2014-01-14 13:44:21
可直接在gjf文件里面固定,GV里没试过...
哦,那在gif文件里如何固定,是在命令那一行中吗
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5楼
2014-01-14 13:52:20
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5楼
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跃龙门的鱼
at 2014-01-14 13:52:20
哦,那在gif文件里如何固定,是在命令那一行中吗...
分子描述之后空一行输入,具体实现方法查下高斯手册吧
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6楼
2014-01-14 14:07:44
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很有帮助
2014-01-14 16:07:07
在高斯view的菜单栏里面专门有一个分层的工具,在里面可以选择设定高层和低层,这样低层就相当于冻结了原子。
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7楼
2014-01-14 16:05:36
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wangsihang
at 2014-01-14 16:05:36
在高斯view的菜单栏里面专门有一个分层的工具,在里面可以选择设定高层和低层,这样低层就相当于冻结了原子。
好的,非常感谢,我试试。
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8楼
2014-01-14 16:07:26
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枪下游魂
at 2014-01-14 14:07:44
分子描述之后空一行输入,具体实现方法查下高斯手册吧...
好的,非常感谢
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9楼
2014-01-14 16:08:00
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那我如何在GASSION VIEWER中固定那些片段...
1.Edit --> redundant coordinates
2.在弹出对话框里鼠标左键单击“add”
3.用鼠标左键点中要fix的原子(只能点1个)
4.在弹出对话框里选择“cartesian coordinate”
GOTO 2.
一直到把想固定的原子选择完毕,鼠标左键单击“OK”退出。
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跃龙门的鱼
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