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跃龙门的鱼

银虫 (正式写手)

[求助] 求助：请问各位高手在高斯09中优化单个分子时如何把一部分的参数固定了，优化其他部分 已有3人参与

请问各位高手在高斯09中优化单个分子时如何把一部分的参数固定了，优化其他部分，也就是建一个刚性结构，在高斯中如何操作，非常感谢！
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1楼 2014-01-14 13:00:21
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枪下游魂

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
跃龙门的鱼: 金币+5, ★有帮助 2014-01-14 16:07:42
如果这个片段要参与优化，可用opt=modredundant；
如果这个片段不参与优化，可用opt=readfreeze；
还可以通过ONIOM分层的方式来做。
具体适用方法请翻阅高斯手册
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2楼2014-01-14 13:17:35
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跃龙门的鱼

银虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 枪下游魂 at 2014-01-14 13:17:35
如果这个片段要参与优化，可用opt=modredundant；
如果这个片段不参与优化，可用opt=readfreeze；
还可以通过ONIOM分层的方式来做。
具体适用方法请翻阅高斯手册

那我如何在GASSION VIEWER中固定那些片段
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3楼2014-01-14 13:42:10
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枪下游魂

木虫 (著名写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 跃龙门的鱼 at 2014-01-14 13:42:10
那我如何在GASSION VIEWER中固定那些片段...

可直接在gjf文件里面固定，GV里没试过
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4楼2014-01-14 13:44:21
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跃龙门的鱼

银虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 枪下游魂 at 2014-01-14 13:44:21
可直接在gjf文件里面固定，GV里没试过...

哦，那在gif文件里如何固定，是在命令那一行中吗
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5楼2014-01-14 13:52:20
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枪下游魂

木虫 (著名写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by 跃龙门的鱼 at 2014-01-14 13:52:20
哦，那在gif文件里如何固定，是在命令那一行中吗...

分子描述之后空一行输入，具体实现方法查下高斯手册吧
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6楼2014-01-14 14:07:44
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wangsihang

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
跃龙门的鱼: 金币+10, ★★★很有帮助 2014-01-14 16:07:07
在高斯view的菜单栏里面专门有一个分层的工具，在里面可以选择设定高层和低层，这样低层就相当于冻结了原子。
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7楼2014-01-14 16:05:36
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跃龙门的鱼

银虫 (正式写手)
引用回帖:
7楼: Originally posted by wangsihang at 2014-01-14 16:05:36
在高斯view的菜单栏里面专门有一个分层的工具，在里面可以选择设定高层和低层，这样低层就相当于冻结了原子。

好的，非常感谢，我试试。
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8楼2014-01-14 16:07:26
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跃龙门的鱼

银虫 (正式写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by 枪下游魂 at 2014-01-14 14:07:44
分子描述之后空一行输入，具体实现方法查下高斯手册吧...

好的，非常感谢
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9楼2014-01-14 16:08:00
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yongleli

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
跃龙门的鱼: 金币+5 2014-01-15 10:43:41
引用回帖:
3楼: Originally posted by 跃龙门的鱼 at 2014-01-14 13:42:10
那我如何在GASSION VIEWER中固定那些片段...

1.Edit --> redundant coordinates
2.在弹出对话框里鼠标左键单击“add”
3.用鼠标左键点中要fix的原子（只能点1个）
4.在弹出对话框里选择“cartesian coordinate”
GOTO 2.
一直到把想固定的原子选择完毕，鼠标左键单击“OK”退出。
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跃龙门的鱼
10楼2014-01-15 06:54:46
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