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跃龙门的鱼

银虫 (正式写手)

[求助] 求助:请问各位高手在高斯09中优化单个分子时如何把一部分的参数固定了,优化其他部分 已有3人参与

请问各位高手在高斯09中优化单个分子时如何把一部分的参数固定了,优化其他部分,也就是建一个刚性结构,在高斯中如何操作,非常感谢!
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yongleli

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
跃龙门的鱼: 金币+5 2014-01-15 10:43:41
引用回帖:
3楼: Originally posted by 跃龙门的鱼 at 2014-01-14 13:42:10
那我如何在GASSION VIEWER中固定那些片段...

1.Edit --> redundant coordinates
2.在弹出对话框里鼠标左键单击“add”
3.用鼠标左键点中要fix的原子(只能点1个)
4.在弹出对话框里选择“cartesian coordinate”
GOTO 2.
一直到把想固定的原子选择完毕,鼠标左键单击“OK”退出。

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10楼2014-01-15 06:54:46
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枪下游魂

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
跃龙门的鱼: 金币+5, ★有帮助 2014-01-14 16:07:42
如果这个片段要参与优化,可用opt=modredundant;
如果这个片段不参与优化,可用opt=readfreeze;
还可以通过ONIOM分层的方式来做。
具体适用方法请翻阅高斯手册
2楼2014-01-14 13:17:35
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跃龙门的鱼

银虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 枪下游魂 at 2014-01-14 13:17:35
如果这个片段要参与优化,可用opt=modredundant;
如果这个片段不参与优化,可用opt=readfreeze;
还可以通过ONIOM分层的方式来做。
具体适用方法请翻阅高斯手册

那我如何在GASSION VIEWER中固定那些片段
3楼2014-01-14 13:42:10
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枪下游魂

木虫 (著名写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 跃龙门的鱼 at 2014-01-14 13:42:10
那我如何在GASSION VIEWER中固定那些片段...

可直接在gjf文件里面固定,GV里没试过
4楼2014-01-14 13:44:21
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