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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 求助高斯输出文件中坐标系怎么定义的？
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350161129

铁虫 (初入文坛)

[求助] 求助高斯输出文件中坐标系怎么定义的？

高斯输出文件中坐标系怎么定义的，是一般定义沿本初子午线，还是沿转动惯量主轴？
偶极距三个分量分别是沿什么方向的？Dipole moment (field-independent basis, Debye):
    X=              0.7060    Y=             -2.1592    Z=              1.2194  Tot=              2.5783
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1楼2013-11-04 14:34:17
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sobereva

至尊木虫 (著名写手)

本人已永久离开小木虫
★ ★ ★
gmy1990: 金币+3 2013-11-09 00:30:21
将结构保存为xyz或pdb文件，然后用Multiwfn程序载入，进入其主功能100里的功能21并输入all，就会输出体系的三个主轴矢量。与偶极矩矢量的夹角θ自行根据公式a·b=|a||b|cosθ即可求得
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4楼2013-11-07 06:03:30
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sobereva

至尊木虫 (著名写手)

本人已永久离开小木虫
引用回帖:
5楼: Originally posted by 350161129 at 2013-11-07 21:56:36
Multiwfn程序从哪儿下呀，从来没用过...

见我的签名档。
Multiwfn的介绍见《Multiwfn 3.0波函数分析程序的意义、功能与用途》http://hi.baidu.com/sobereva/item/b35581418db96cea1f19bc09，使用入门见《Multiwfn入门tips》http://hi.baidu.com/sobereva/item/896ee3a19f6d7d3c020a4d76
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6楼2013-11-08 04:41:36
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sobereva

至尊木虫 (著名写手)

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★ ★
gmy1990: 金币+2 2013-11-13 19:32:52
principal axes矩阵的每一列代表一个主轴矢量，手册3.100.21有计算公式。
如前面回复中已经提到的，根据主轴矢量和偶极矩矢量经过简单手算就能得到夹角。
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9楼2013-11-08 14:57:18
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sobereva

至尊木虫 (著名写手)

本人已永久离开小木虫
引用回帖:
10楼: Originally posted by 350161129 at 2013-11-13 17:30:49
手册里的意思是不是还要求特征值呀，线性代数实在没学好，而且这里的偶极距跟高斯里差好远呀，请问你会用高斯求偶极距与转动惯量夹角吗？...

你图中的偶极矩是用原子核电荷算的偶极矩，分子偶极矩还得加上电子对偶极矩的贡献。分子偶极矩在高斯最后已经给出了。
用不着自己求矩阵本征值，Multiwfn已经做了对角化，三个本征值就是相对于主轴的转动惯量，三个本征向量就是三个主轴矢量，这些都已经在你的截图中输出了。
怎么算两个矢量的夹角在前面的回帖已经给出公式了，是极为简单的数学问题。

应当注意查资料、想明白理论，不要盲目计算。
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350161129
11楼2013-11-13 21:31:33
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枪下游魂

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
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gmy1990: 金币+2 2013-11-04 21:57:58
用GV载入log文件，右键view里面可显示坐标轴，偶极矩3个分量就是沿着x，y，z轴啊
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2楼2013-11-04 19:58:01
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350161129

铁虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 枪下游魂 at 2013-11-04 19:58:01
用GV载入log文件，右键view里面可显示坐标轴，偶极矩3个分量就是沿着x，y，z轴啊

请问你知道转动惯量主轴怎么看吗。？偶极距与转动惯量夹角怎么可以求出来吗？
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3楼2013-11-06 23:07:52
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350161129

铁虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by sobereva at 2013-11-07 06:03:30
将结构保存为xyz或pdb文件，然后用Multiwfn程序载入，进入其主功能100里的功能21并输入all，就会输出体系的三个主轴矢量。与偶极矩矢量的夹角θ自行根据公式a·b=|a||b|cosθ即可求得

Multiwfn程序从哪儿下呀，从来没用过
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5楼2013-11-07 21:56:36
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350161129

铁虫 (初入文坛)
引用回帖:
6楼: Originally posted by sobereva at 2013-11-08 04:41:36
见我的签名档。
Multiwfn的介绍见《Multiwfn 3.0波函数分析程序的意义、功能与用途》http://hi.baidu.com/sobereva/item/b35581418db96cea1f19bc09，使用入门见《Multiwfn入门tips》http://hi.baidu.com/sobereva ...

这里求出得角度跟高斯算出的会不一样吗？那能不能再请教一下极化率9个分量怎么求呢?
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7楼2013-11-08 11:08:12
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350161129

铁虫 (初入文坛)
实在看不懂这个输出文件什么意思，不知道怎么求出偶极距与转动惯量夹角，不知道应该取那个量，能不能请你帮我分析一下呀？多谢了
求助高斯输出文件中坐标系怎么定义的？
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求助高斯输出文件中坐标系怎么定义的？-1
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8楼2013-11-08 11:24:37
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350161129

铁虫 (初入文坛)
引用回帖:
9楼: Originally posted by sobereva at 2013-11-08 14:57:18
principal axes矩阵的每一列代表一个主轴矢量，手册3.100.21有计算公式。
如前面回复中已经提到的，根据主轴矢量和偶极矩矢量经过简单手算就能得到夹角。

手册里的意思是不是还要求特征值呀，线性代数实在没学好，而且这里的偶极距跟高斯里差好远呀，请问你会用高斯求偶极距与转动惯量夹角吗？
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10楼2013-11-13 17:30:49
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