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紧急求助高斯扫势能曲线(同分子中不同基团之间的距离如何定义)
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如题,想做一个同一分子体系中势能随着两个基团间距离变化的曲线,比如说CH4中想要以CH基团与另外3个H组成的基团之间的距离作为键长变化量,然后这个距离定义为C原子与C-H键延长线与剩下的3个H形成的平面之间的相交点之间的距离。 本人是高斯菜鸟,只会做固定一个键的刚性扫描... 盼大家指教,能有举例最好,不然提供下思路也行。。。实在无从下手 |
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yongleli
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【答案】应助回帖
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cenwanglai: 金币+3, 谢谢回复,过年了~ 2013-02-03 22:19:18
cenwanglai: 金币+3, 谢谢回复,过年了~ 2013-02-03 22:19:18
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按照《调节平面分子间距的方法》(http://hi.baidu.com/sobereva/item/fd1854f98c4fd9d643c36acd)中的方法1获得C在三个氢原子定义的平面上的投影点,设为虚原子。然后扫描时就扫描C和虚原子之间的键长即可。 你也可以用此文的方法2让三个H所在的平面与XY平面平行,然后让这三个氢的Z坐标用同一个变量表示,然后然后扫描这个变量。 |
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4楼2013-02-02 17:59:23
5楼2013-04-02 19:17:15










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zheyi-1984
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