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紧急求助高斯扫势能曲线（同分子中不同基团之间的距离如何定义）
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如题，想做一个同一分子体系中势能随着两个基团间距离变化的曲线，比如说CH4中想要以CH基团与另外3个H组成的基团之间的距离作为键长变化量，然后这个距离定义为C原子与C-H键延长线与剩下的3个H形成的平面之间的相交点之间的距离。 本人是高斯菜鸟，只会做固定一个键的刚性扫描... 盼大家指教，能有举例最好，不然提供下思路也行。。。实在无从下手 |
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yongleli
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cenwanglai: 金币+3, 谢谢回复，过年了~ 2013-02-03 22:19:18
cenwanglai: 金币+3, 谢谢回复，过年了~ 2013-02-03 22:19:18
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按照《调节平面分子间距的方法》（http://hi.baidu.com/sobereva/item/fd1854f98c4fd9d643c36acd）中的方法1获得C在三个氢原子定义的平面上的投影点，设为虚原子。然后扫描时就扫描C和虚原子之间的键长即可。 你也可以用此文的方法2让三个H所在的平面与XY平面平行，然后让这三个氢的Z坐标用同一个变量表示，然后然后扫描这个变量。 |
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zheyi-19844楼2013-02-02 17:59:23
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