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asaki

铜虫 (小有名气)

[求助] 高斯扫势能面的问题

课题需要需要对一个催化机制进行讨论
在扫势能面得时候,首先提交的是
%chk=surface-scan.chk
%mem=2900Mb
%nproc=8
# opt=(gdiis,micro,loose,modredundant) oniom(b3lyp/6-31g(d):amber=hardfirst) geom=connectivity

surface-scan


坐标等信息。。。


2789 2921 2.20 S 9 -0.1           
2799 2920 1.90 S 9 -0.1      


但是在扫面的时候经常发现CPU的占用率只有20%几,我并的是8核啊 为啥会出现这种情况呢?



还有一种我尝试的方法是固定其中一组进行扫面

2789 2921 2.20 F         
2799 2920 1.90 S 9 -0.1  


但是为什么扫出来的结果中前面那个我固定的一对原子的距离一直在变的?有时候时2.2 有时候是2.5 非常不解

求助大家啊
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xianyuanshan

木虫 (正式写手)

linux下还是win下?
越成熟意味着越接近死亡
2楼2011-05-06 10:44:21
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asaki

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by xianyuanshan at 2011-05-06 10:44:21:
linux下还是win下?

nihao  是linux下
3楼2011-05-06 11:14:42
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xj544

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

asaki(金币+2): 2011-05-11 20:55:18
“还有一种我尝试的方法是固定其中一组进行扫面

2789 2921 2.20 F         
2799 2920 1.90 S 9 -0.1  


但是为什么扫出来的结果中前面那个我固定的一对原子的距离一直在变的?有时候时2.2 有时候是2.5 非常不解”


你看看 Initial Parameters中有没有Frozen?
有,就是固定了。
4楼2011-05-10 17:01:02
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asaki

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by xj544 at 2011-05-10 17:01:02:
“还有一种我尝试的方法是固定其中一组进行扫面

2789 2921 2.20 F         
2799 2920 1.90 S 9 -0.1  


但是为什么扫出来的结果中前面那个我固定的一对原子的距离一直在变的?有时候时2.2 有时候是2. ...

你好,单纯从out文件中看到是已经固定了,但是实际结果却是这个距离在动

不过谢谢 长时间计算直接扫面的结果也快出来了,这个应该更连续写
5楼2011-05-11 20:56:09
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游子8921

铁杆木虫 (知名作家)

游子8921

%chk=surface-scan.chk
%mem=2900Mb
%nproc=8
# opt=(gdiis,micro,loose,modredundant) oniom(b3lyp/6-31g(d):amber=hardfirst) geom=connectivity
你好,请教这是势能面扫描命令吗?谢谢
为了自己的目标而奋斗,一切皆有可能
6楼2011-05-21 22:17:05
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asaki

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by 游子8921 at 2011-05-21 22:17:05:
%chk=surface-scan.chk
%mem=2900Mb
%nproc=8
# opt=(gdiis,micro,loose,modredundant) oniom(b3lyp/6-31g(d):amber=hardfirst) geom=connectivity
你好,请教这是势能面扫描命令吗?谢谢

这个是modredundant关键字的势能面扫描 其他也有的 包括TS等 这个具体要根绝文献或者其他的参考的
7楼2011-05-23 15:40:12
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