24小时热门版块排行榜    

查看: 2009  |  回复: 6

asaki

铜虫 (小有名气)

[求助] 高斯扫势能面的问题

课题需要需要对一个催化机制进行讨论
在扫势能面得时候,首先提交的是
%chk=surface-scan.chk
%mem=2900Mb
%nproc=8
# opt=(gdiis,micro,loose,modredundant) oniom(b3lyp/6-31g(d):amber=hardfirst) geom=connectivity

surface-scan


坐标等信息。。。


2789 2921 2.20 S 9 -0.1           
2799 2920 1.90 S 9 -0.1      


但是在扫面的时候经常发现CPU的占用率只有20%几,我并的是8核啊 为啥会出现这种情况呢?



还有一种我尝试的方法是固定其中一组进行扫面

2789 2921 2.20 F         
2799 2920 1.90 S 9 -0.1  


但是为什么扫出来的结果中前面那个我固定的一对原子的距离一直在变的?有时候时2.2 有时候是2.5 非常不解

求助大家啊
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xianyuanshan

木虫 (正式写手)

linux下还是win下?
越成熟意味着越接近死亡
2楼2011-05-06 10:44:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

asaki

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by xianyuanshan at 2011-05-06 10:44:21:
linux下还是win下?

nihao  是linux下
3楼2011-05-06 11:14:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xj544

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

asaki(金币+2): 2011-05-11 20:55:18
“还有一种我尝试的方法是固定其中一组进行扫面

2789 2921 2.20 F         
2799 2920 1.90 S 9 -0.1  


但是为什么扫出来的结果中前面那个我固定的一对原子的距离一直在变的?有时候时2.2 有时候是2.5 非常不解”


你看看 Initial Parameters中有没有Frozen?
有,就是固定了。
4楼2011-05-10 17:01:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

asaki

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by xj544 at 2011-05-10 17:01:02:
“还有一种我尝试的方法是固定其中一组进行扫面

2789 2921 2.20 F         
2799 2920 1.90 S 9 -0.1  


但是为什么扫出来的结果中前面那个我固定的一对原子的距离一直在变的?有时候时2.2 有时候是2. ...

你好,单纯从out文件中看到是已经固定了,但是实际结果却是这个距离在动

不过谢谢 长时间计算直接扫面的结果也快出来了,这个应该更连续写
5楼2011-05-11 20:56:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

游子8921

铁杆木虫 (知名作家)

游子8921

%chk=surface-scan.chk
%mem=2900Mb
%nproc=8
# opt=(gdiis,micro,loose,modredundant) oniom(b3lyp/6-31g(d):amber=hardfirst) geom=connectivity
你好,请教这是势能面扫描命令吗?谢谢
为了自己的目标而奋斗,一切皆有可能
6楼2011-05-21 22:17:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

asaki

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by 游子8921 at 2011-05-21 22:17:05:
%chk=surface-scan.chk
%mem=2900Mb
%nproc=8
# opt=(gdiis,micro,loose,modredundant) oniom(b3lyp/6-31g(d):amber=hardfirst) geom=connectivity
你好,请教这是势能面扫描命令吗?谢谢

这个是modredundant关键字的势能面扫描 其他也有的 包括TS等 这个具体要根绝文献或者其他的参考的
7楼2011-05-23 15:40:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 asaki 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 欢迎发来filecode的Mz6后的代码验证其规律 +55 医学老男孩 2026-08-13 123/6150 2026-08-19 23:44 by stan_et
[基金申请] 今天基金会出结果吗?20260819 +13 kkkl_v 2026-08-19 13/650 2026-08-19 22:37 by 宝贝虫子
[基金申请] 时间戳变了,能看出什么问题? +12 基诺咪客 2026-08-17 16/800 2026-08-19 22:04 by kk 的小木虫
[基金申请] filecode,4个jtjc了 +11 ziyangfang 2026-08-19 13/650 2026-08-19 21:28 by aasahr
[教师之家] 为什么余额宝的年化利率越来越低?主要原因有哪些? +5 瞬息宇宙 2026-08-15 5/250 2026-08-19 20:23 by super2002521
[基金申请] 今天放榜没戏了吧 +4 yuleib84 2026-08-19 5/250 2026-08-19 19:52 by hhs666
[基金申请] 今天放榜吗? +14 布布和一二 2026-08-19 15/750 2026-08-19 18:07 by gltch
[基金申请] filecode=后面第一个是大写字母 +10 wangze12014 2026-08-14 12/600 2026-08-19 16:56 by 苦难博士
[基金申请] 快农历七夕节了,轻松一下,男人悄悄话,女施主请不要进来。 +6 Tide man 2026-08-14 7/350 2026-08-19 09:56 by ZJTJZ
[基金申请] 什么时候开奖? +6 CrisMessi 2026-08-18 6/300 2026-08-19 08:06 by Equinoxhua
[基金申请] 重要消息,中午系统在维护 +10 yuleib84 2026-08-18 11/550 2026-08-19 07:30 by 羽毛枫f
[基金申请] 明天放榜? +5 Shxjjxjkx 2026-08-18 5/250 2026-08-18 18:14 by -大大大大大-
[论文投稿] 投稿咨询 +4 wwm09 2026-08-17 6/300 2026-08-18 15:36 by wwm09
[基金申请] 时间戳又变了8-15 +14 archvillain 2026-08-15 26/1300 2026-08-18 13:37 by phantomgost
[基金申请] 今天维护系统维护 祝所有人 高中 +8 gjjjzhong 2026-08-18 9/450 2026-08-18 13:01 by 家与远方
[基金申请] 哪位老哥知道今年的国自然具体哪一天放榜? +13 Ldrop2023 2026-08-13 16/800 2026-08-18 12:25 by 淀粉搬运工
[基金申请] 感觉是下周放榜了 +6 angus9576 2026-08-17 11/550 2026-08-17 23:57 by angus9576
[基金申请] 今天系统多次维护,明天很可能放榜! +8 zju2000 2026-08-16 9/450 2026-08-17 12:20 by lmz0216
[精细化工] 招聘 金属平磨液,抛光液研发工程师 +3 小天0311 2026-08-14 3/150 2026-08-16 07:31 by H9PLUS
[基金申请] 各位道友,我要去昆明玩几天,回来见。 +7 Tide man 2026-08-14 8/400 2026-08-15 01:11 by arzu_hma
信息提示
请填处理意见