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sunzhiguo

金虫 (正式写手)

[交流] 【求助】高斯中坐标固定和冻结核是一回事吗?

在高斯中,晶体(分子筛)结构优化时,为了保持构型,常将一些原子的坐标固定。它和冻结核是一回事吗?我应该在笛卡尔坐标前加-1,还是比1大的负整数?大家是怎样将原子坐标固定的?我理解冻结核是将原子内层轨道冻结,跟固定坐标有什么关系呢?
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ykwang

金虫 (正式写手)


zhou2009(金币+1): 2010-11-02 12:02:04
固定坐标和冻核是风马牛不相接的两件事。
Nothing_Is_Impossible!
2楼2010-11-02 10:37:13
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sunzhiguo

金虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by ykwang at 2010-11-02 10:37:13:
固定坐标和冻核是风马牛不相接的两件事。

那么请问怎么实现固定一些框架原子 的坐标,怎么操作?
3楼2010-11-02 14:15:08
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zhou2009

版主 (著名写手)

sunzhiguo(金币+1): 2010-11-02 18:42:07
将一些原子的坐标固定,是在笛卡尔坐标前加-1。

冻结核是将原子内层轨道冻结,如在计算电子密度时,只计算外层价电子的密度。
4楼2010-11-02 14:26:26
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sunzhiguo

金虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by zhou2009 at 2010-11-02 14:26:26:
将一些原子的坐标固定,是在笛卡尔坐标前加-1。

冻结核是将原子内层轨道冻结,如在计算电子密度时,只计算外层价电子的密度。

多谢回答,好像看到笛卡尔坐标前加比1大的负整数,是将这些原子作为刚性的集团,和加-1有什么区别呢?另外,将某些原子松弛是在笛卡尔坐标前加0吗?怎么确定在优化过程中,某些原子的坐标确实是固定的?恳请指点。
5楼2010-11-02 18:33:14
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sunzhiguo

金虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by zhou2009 at 2010-11-02 14:26:26:
将一些原子的坐标固定,是在笛卡尔坐标前加-1。

冻结核是将原子内层轨道冻结,如在计算电子密度时,只计算外层价电子的密度。

多谢回答,好像看到笛卡尔坐标前加比1大的负整数,是将这些原子作为刚性的集团,和加-1有什么区别呢?另外,将某些原子松弛是在笛卡尔坐标前加0吗?怎么确定在优化过程中,某些原子的坐标确实是固定的?恳请指点。
6楼2010-11-02 18:33:43
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