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yegui808095银虫 (小有名气)
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如何让高斯在优化结构时保持其中某个单键不变
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| 我刚接触高斯，好多东西都不懂。现在老师交给我一个课题，需要将C60和二苯铬之间用两个单键连接起来，两者之间发生的是【2+4】加成作用。我搭好结构让高斯优化，每次优化完后两者之间的单键都消失了，我想问下为什么？如果我想让高斯在优化结构时保持这两个单键一直存在，输入文件要怎么改？ |
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可以设置关键字Opt=modredundant，然后在分子坐标下面空一行，写上需要固定不动的原子编号，后面空一格加上F，比如一个丙烷分子，需要固定C-C键，输入文件如下 # hf/3-21g opt=modredundant title 0 1 C 0.04464286 0.02976190 0.00000000 H 0.40131570 0.53416009 0.87365150 H 0.40131570 0.53416009 -0.87365150 H -1.02535714 0.02977509 0.00000000 C 0.55795857 -1.42217025 0.00000000 H 0.20128633 -1.92656823 0.87365187 H 0.20128514 -1.92656865 -0.87365114 H 1.62795857 -1.42218343 -0.00000073 1 F 5 F |
2楼2013-02-26 22:17:25
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你说的单键消失是如何判定的需要明确一下。 如果仅仅是用GaussView打开时发现需要连键的原子之间没有连键，还不足以判定单键消失。 GaussView显示的连不连键是由该软件内置的原子半径阈值之和决定的。不能说GaussView显示连键你就认为是成键，而它显示不连键你就认为不成键。 你需要用自己的化学和结构学知识根据实际原子间距和原子间的成键水平（运行个NBO）等情况来综合判断。 |
3楼2013-02-28 09:04:41
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