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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 如何让高斯在优化结构时保持其中某个单键不变
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yegui808095

银虫 (小有名气)

[求助] 如何让高斯在优化结构时保持其中某个单键不变

我刚接触高斯，好多东西都不懂。现在老师交给我一个课题，需要将C60和二苯铬之间用两个单键连接起来，两者之间发生的是【2+4】加成作用。我搭好结构让高斯优化，每次优化完后两者之间的单键都消失了，我想问下为什么？如果我想让高斯在优化结构时保持这两个单键一直存在，输入文件要怎么改？
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安安静静，认认真真
1楼 2013-02-26 18:32:44
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yegui808095

银虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by hairan at 2013-02-28 09:04:41
你说的单键消失是如何判定的需要明确一下。
如果仅仅是用GaussView打开时发现需要连键的原子之间没有连键，还不足以判定单键消失。
GaussView显示的连不连键是由该软件内置的原子半径阈值之和决定的。不能说Gauss ...

非常感谢您的回复，请问您所说的“用自己的化学和结构学知识根据实际原子间距和原子间的成键水平（运行个NBO）等情况来综合判断”，能否具体一点？我今年研一，本科学的物理，对化学懂的不多。非常感谢！
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安安静静，认认真真
4楼2013-02-28 16:15:05
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yegui808095

银虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by ter20 at 2013-02-26 22:17:25
可以设置关键字Opt=modredundant，然后在分子坐标下面空一行，写上需要固定不动的原子编号，后面空一格加上F，比如一个丙烷分子，需要固定C-C键，输入文件如下
# hf/3-21g opt=modredundant

title

0 1
C   ...

谢谢您的回复。如果如您所说，我要固定两个单键，是要在原子说明部分后空一行，然后写上
1 F
2 F
3 F
4 F
请问是这样吗？
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安安静静，认认真真
5楼2013-02-28 16:17:34
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yegui808095

银虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by hairan at 2013-02-28 16:54:01
这个我没办法帮你，需要你对你自己研究的体系有一定的经验。
打个比方C-C单键的标准键长一般取金刚石中的C-C距离（1.54 埃），在GaussView中比这个距离长了0.1埃以内的C-C距离它还显示是成键，多超出一点也会显示 ...

好的，我知道了，非常感谢您
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安安静静，认认真真
7楼2013-03-03 18:41:01
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