| 查看: 2529 | 回复: 7 | |||
yegui808095银虫 (小有名气)
|
[求助]
如何让高斯在优化结构时保持其中某个单键不变
|
| 我刚接触高斯，好多东西都不懂。现在老师交给我一个课题，需要将C60和二苯铬之间用两个单键连接起来，两者之间发生的是【2+4】加成作用。我搭好结构让高斯优化，每次优化完后两者之间的单键都消失了，我想问下为什么？如果我想让高斯在优化结构时保持这两个单键一直存在，输入文件要怎么改？ |
回复此楼» 猜你喜欢
中科院西安光机所——促进学术交流，推动产学研融合，分享领域成果，加强校企合作。
已经有0人回复
-
分子动力学 Plumed教程求助
已经有0人回复
-
物理化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有196人回复
-
研究生学术新锐奖｜宁波微纳材料研讨会参会通知
已经有2人回复
-
申请2027年材料/化学类博士
已经有6人回复
-
求相关合成条件
已经有12人回复
-
2027春季申博自荐
已经有6人回复
-
青基的材料青椒们，可以把硕士联培生送我这里，要研二男生
已经有63人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 优化好的分子结构，用gaussview打开后保存为高斯输入文件，再用该文件做TD，对吗
已经有5人回复
- 高斯优化过渡态，有两个虚频，一个想要，想把另一个消掉-----请高手指点
已经有10人回复
- 大侠，我用高斯对同一个结构进行优化，用高精度算没有虚频，为什么半经验AM1算有虚呀
已经有5人回复
- 高斯计算中金属离子与氯苯的相互作用结构优化错误
已经有17人回复
- 高斯几何优化输出时“找不到指定文件”怎么回事啊？
已经有3人回复
- 怎样用高斯优化含有两个分子的反应物?
已经有8人回复
- 高斯计算求助，优化（CLOF2)2NiF6几何结构
已经有3人回复
- [求助]：高斯中的CIS是否能够优化开壳层的激发态结构，例如双重态，四重态的激发态
已经有8人回复
- 能用高斯优化指定某个原子带电荷的离子么？
已经有9人回复
- 【求助】Ms如何导入通过高斯优化好的结构
已经有9人回复
- 【求助】用高斯优化结构
已经有6人回复
- 【求助】高斯优化某阴离子自旋多重度为2时，分子轨道含义及其怎么命名呢？
已经有8人回复
- 【求助】高斯计算优化时opt与opt=tight int=ultrafine 哪个更好？
已经有3人回复
- 【求助】请教有关应用高斯软件优化分子结构时的问题
已经有6人回复
- 【求助】高斯优化结构出错
已经有3人回复
- 【求助】怎么可以看到高斯每一步优化后的结构？
已经有11人回复
- 【讨论】高斯中优化结构时gdiis, calcfc, calcall 的用处和具体用法。
已经有3人回复
ter20
铁杆木虫 (正式写手)
- QC强帖: 1
- 应助: 28 (小学生)
- 金币: 6026.5
- 散金: 99
- 红花: 6
- 帖子: 426
- 在线: 119.8小时
- 虫号: 541263
- 注册: 2008-04-07
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
gmy1990: 金币+2 2013-02-26 22:30:15
yegui808095: 金币+3, ★有帮助 2013-03-24 18:30:22
感谢参与，应助指数 +1
gmy1990: 金币+2 2013-02-26 22:30:15
yegui808095: 金币+3, ★有帮助 2013-03-24 18:30:22
|
可以设置关键字Opt=modredundant，然后在分子坐标下面空一行，写上需要固定不动的原子编号，后面空一格加上F，比如一个丙烷分子，需要固定C-C键，输入文件如下 # hf/3-21g opt=modredundant title 0 1 C 0.04464286 0.02976190 0.00000000 H 0.40131570 0.53416009 0.87365150 H 0.40131570 0.53416009 -0.87365150 H -1.02535714 0.02977509 0.00000000 C 0.55795857 -1.42217025 0.00000000 H 0.20128633 -1.92656823 0.87365187 H 0.20128514 -1.92656865 -0.87365114 H 1.62795857 -1.42218343 -0.00000073 1 F 5 F |
2楼2013-02-26 22:17:25
hairan
木虫 (著名写手)
瞌睡木虫
- QC强帖: 3
- 应助: 61 (初中生)
- 贵宾: 1.06
- 金币: 4974.3
- 散金: 8072
- 红花: 44
- 帖子: 2901
- 在线: 733.4小时
- 虫号: 432069
- 注册: 2007-08-12
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
gmy1990: 金币+3 2013-02-28 09:51:43
yegui808095: 金币+7, ★★★★★最佳答案 2013-03-24 18:30:35
感谢参与，应助指数 +1
gmy1990: 金币+3 2013-02-28 09:51:43
yegui808095: 金币+7, ★★★★★最佳答案 2013-03-24 18:30:35
|
你说的单键消失是如何判定的需要明确一下。 如果仅仅是用GaussView打开时发现需要连键的原子之间没有连键，还不足以判定单键消失。 GaussView显示的连不连键是由该软件内置的原子半径阈值之和决定的。不能说GaussView显示连键你就认为是成键，而它显示不连键你就认为不成键。 你需要用自己的化学和结构学知识根据实际原子间距和原子间的成键水平（运行个NBO）等情况来综合判断。 |
3楼2013-02-28 09:04:41
yegui808095
银虫 (小有名气)
- 应助: 1 (幼儿园)
- 金币: 1362
- 红花: 1
- 帖子: 78
- 在线: 49.8小时
- 虫号: 2174261
- 注册: 2012-12-08
- 性别: MM
- 专业: 理论和计算化学
4楼2013-02-28 16:15:05
yegui808095
银虫 (小有名气)
- 应助: 1 (幼儿园)
- 金币: 1362
- 红花: 1
- 帖子: 78
- 在线: 49.8小时
- 虫号: 2174261
- 注册: 2012-12-08
- 性别: MM
- 专业: 理论和计算化学
5楼2013-02-28 16:17:34
hairan
木虫 (著名写手)
瞌睡木虫
- QC强帖: 3
- 应助: 61 (初中生)
- 贵宾: 1.06
- 金币: 4974.3
- 散金: 8072
- 红花: 44
- 帖子: 2901
- 在线: 733.4小时
- 虫号: 432069
- 注册: 2007-08-12
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
6楼2013-02-28 16:54:01
yegui808095
银虫 (小有名气)
- 应助: 1 (幼儿园)
- 金币: 1362
- 红花: 1
- 帖子: 78
- 在线: 49.8小时
- 虫号: 2174261
- 注册: 2012-12-08
- 性别: MM
- 专业: 理论和计算化学
7楼2013-03-03 18:41:01
ter20
铁杆木虫 (正式写手)
- QC强帖: 1
- 应助: 28 (小学生)
- 金币: 6026.5
- 散金: 99
- 红花: 6
- 帖子: 426
- 在线: 119.8小时
- 虫号: 541263
- 注册: 2008-04-07
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
8楼2013-03-25 08:11:58
30
