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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 如何让高斯在优化结构时保持其中某个单键不变
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yegui808095

银虫 (小有名气)

[求助] 如何让高斯在优化结构时保持其中某个单键不变

我刚接触高斯，好多东西都不懂。现在老师交给我一个课题，需要将C60和二苯铬之间用两个单键连接起来，两者之间发生的是【2+4】加成作用。我搭好结构让高斯优化，每次优化完后两者之间的单键都消失了，我想问下为什么？如果我想让高斯在优化结构时保持这两个单键一直存在，输入文件要怎么改？
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安安静静，认认真真
1楼 2013-02-26 18:32:44
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yegui808095

银虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by hairan at 2013-02-28 16:54:01
这个我没办法帮你，需要你对你自己研究的体系有一定的经验。
打个比方C-C单键的标准键长一般取金刚石中的C-C距离（1.54 埃），在GaussView中比这个距离长了0.1埃以内的C-C距离它还显示是成键，多超出一点也会显示 ...

好的，我知道了，非常感谢您
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安安静静，认认真真
7楼2013-03-03 18:41:01
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ter20

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
gmy1990: 金币+2 2013-02-26 22:30:15
yegui808095: 金币+3, ★有帮助 2013-03-24 18:30:22
可以设置关键字Opt=modredundant，然后在分子坐标下面空一行，写上需要固定不动的原子编号，后面空一格加上F，比如一个丙烷分子，需要固定C-C键，输入文件如下
# hf/3-21g opt=modredundant

title

0 1
C                  0.04464286    0.02976190    0.00000000
H                  0.40131570    0.53416009    0.87365150
H                  0.40131570    0.53416009   -0.87365150
H                 -1.02535714    0.02977509    0.00000000
C                  0.55795857   -1.42217025    0.00000000
H                  0.20128633   -1.92656823    0.87365187
H                  0.20128514   -1.92656865   -0.87365114
H                  1.62795857   -1.42218343   -0.00000073

1 F
5 F
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2楼2013-02-26 22:17:25
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hairan

木虫 (著名写手)

瞌睡木虫

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
gmy1990: 金币+3 2013-02-28 09:51:43
yegui808095: 金币+7, ★★★★★最佳答案 2013-03-24 18:30:35
你说的单键消失是如何判定的需要明确一下。
如果仅仅是用GaussView打开时发现需要连键的原子之间没有连键，还不足以判定单键消失。
GaussView显示的连不连键是由该软件内置的原子半径阈值之和决定的。不能说GaussView显示连键你就认为是成键，而它显示不连键你就认为不成键。
你需要用自己的化学和结构学知识根据实际原子间距和原子间的成键水平（运行个NBO）等情况来综合判断。
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据权威报纸调查，84%的青少年犯罪者有玩电子游戏的经历，故应该禁止经营电子游戏。据我们所知，100%的青少年犯罪者有穿鞋的经历，故制鞋厂应该停业。
3楼2013-02-28 09:04:41
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yegui808095

银虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by hairan at 2013-02-28 09:04:41
你说的单键消失是如何判定的需要明确一下。
如果仅仅是用GaussView打开时发现需要连键的原子之间没有连键，还不足以判定单键消失。
GaussView显示的连不连键是由该软件内置的原子半径阈值之和决定的。不能说Gauss ...

非常感谢您的回复，请问您所说的“用自己的化学和结构学知识根据实际原子间距和原子间的成键水平（运行个NBO）等情况来综合判断”，能否具体一点？我今年研一，本科学的物理，对化学懂的不多。非常感谢！
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安安静静，认认真真
4楼2013-02-28 16:15:05
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