| 查看: 2482 | 回复: 4 | ||
starry99木虫 (正式写手)
|
[求助]
高斯对多分子体系的构型优化
|
| 不知道大家有没有人用高斯处理过多分子体系的构型优化，怎样才能比较高效快捷的得到能量最小的构型，而不是局部的极小值。我自己是通过Chem3D画出多分子的体系，然后先通过MM优化得到分子力场的优化结构。而且我还把两个分子摆在不同的位置优化把得到最多的构型作为高斯的输入构型进行优化，但是还是不能得到和文献吻合的结果。希望做过此方面的大牛给些建议谢谢！ |
回复此楼» 本帖已获得的红花（最新10朵）
zhaochuanfan» 猜你喜欢
推荐几个靠谱的文献网站？
已经有1人回复
-
华南师范大学广州市光谱分析与功能探针重点实验室诚招青年英才和博士后岗位研究人员
已经有11人回复
-
物理化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有206人回复
-
华南师范大学广州市光谱分析与功能探针重点实验室诚招青年英才和博士后岗位研究人员
已经有10人回复
-
夏威夷大学生物胶体与界面实验室诚招全奖博士生和博士后
已经有1人回复
-
求助立方晶体In(OH)3的CIF卡片
已经有2人回复
-
求标准卡片Cu0.4In0.4Zn1.2S2 PDF#32-0340
已经有2人回复
-
量子点电致发光器件（QLED）：蓝光量子点（QDs）和纳米氧化锌电子传输材料
已经有0人回复
-
需要一个圆偏振光诱导化学反应，请问使用圆偏振光作为光源，应该需要哪些设备搭建
已经有0人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
高斯优化对称分子，重新算，需要计算资源相对多的帮助一下，就一个分子很快。thanks
已经有6人回复- 高斯view怎么样固定分子的对称性进行优化？
已经有15人回复
- 有没有人知道这个分子怎么命名
已经有3人回复
- 高斯分子优化及频率计算
已经有4人回复
- 如何能在优化后得到这样一个分子模型
已经有5人回复
- 几何结构最优化
已经有10人回复
- 非能量最小点的频率计算(任意结构的频率计算)
已经有14人回复
- 求教如何在chem3D中画出分子结构式以及求出分子的尺寸大小
已经有5人回复
- 高斯中自旋多重度是按照什么要求设置的
已经有7人回复
- 高斯优化构建的小分子，为什么每次优化后的坐标不完全相同？
已经有8人回复
- 怎样给出过渡态初始构型
已经有5人回复
- 求助有关高斯优化和频率计算的收敛问题
已经有4人回复
- 高斯中固定二面角作优化
已经有4人回复
- 高斯计算中固定部分角度作优化
已经有10人回复
- 高斯产生小分子参数问题
已经有6人回复
- 如何用高斯软件计算分子间作用力？
已经有6人回复
- 多重高斯积分fortran程序
已经有4人回复
- 这种分子在高斯中怎么画出来呀
已经有15人回复
- g09中优化构型的能量如何表示
已经有7人回复
- 【讨论】这简直是爆炸反应啊（TNT算毛毛啊），高斯怎能这样优化，有图有真相
已经有8人回复
- 【调查】高斯计算，你算过的最大体系有多少个基函数？
已经有10人回复
- 【求助】有用双系统跑高斯的吗？
已经有19人回复
kaegi
金虫 (小有名气)
- 应助: 9 (幼儿园)
- 金币: 1405.6
- 红花: 6
- 帖子: 276
- 在线: 87.4小时
- 虫号: 880820
- 注册: 2009-10-22
- 性别: GG
- 专业: 物理有机化学
【答案】应助回帖
★ ★
zhou2009(金币+2): 2011-06-13 11:03:39
starry99(金币+4): 呵呵，谢谢 2011-06-13 12:21:42
zhou2009(金币+2): 2011-06-13 11:03:39
starry99(金币+4): 呵呵，谢谢 2011-06-13 12:21:42
|
如果要得到全局最低点我觉得是不可能的，如果有条件的话可以试试能做构象搜索的软件。如果是用高斯的或者一般的量化计算软件，只能依靠人的化学知识做初步猜想得到有限的初始结构。然后再对这些结构进行计算得到不同的局部能量最小值。刻意追求一个真正的全局能量最低点无疑是很耗费时间的，很可能也是没有化学意义的。比如全局最低能量是0.0Kcal，而你找到的局部最低能量是0.2Kcal/mol。即使对于高精度计算来说，这个结果也是非常好的了。主要还是要看你计算的结果能不能说明化学问题，阐释反应现象等等。 |
2楼2011-06-13 10:56:52
starry99
木虫 (正式写手)
- 应助: 1 (幼儿园)
- 金币: 3487.6
- 散金: 336
- 红花: 5
- 帖子: 498
- 在线: 96.6小时
- 虫号: 1042881
- 注册: 2010-06-17
- 性别: GG
- 专业: 催化化学
3楼2011-06-13 12:27:00
kaegi
金虫 (小有名气)
- 应助: 9 (幼儿园)
- 金币: 1405.6
- 红花: 6
- 帖子: 276
- 在线: 87.4小时
- 虫号: 880820
- 注册: 2009-10-22
- 性别: GG
- 专业: 物理有机化学
4楼2011-06-13 18:58:55
zhaochuanfan
木虫 (正式写手)
- 应助: 6 (幼儿园)
- 金币: 4295.8
- 散金: 1110
- 红花: 17
- 帖子: 765
- 在线: 267.2小时
- 虫号: 1235025
- 注册: 2011-03-16
- 专业: 应用有机化学
5楼2012-03-09 20:28:51