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limengru

新虫 (小有名气)

[求助] 怎样给出过渡态初始构型

对于过渡态初始构型按照实现优化的反应物和产物的构型分别在构型和键长上加以调整是不是有利于优化,怎样更好给出初始构型进行优化?
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ggdh

专家顾问 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gmy1990: 金币+2 2013-10-24 23:33:36
一般用扫描反应坐标,能量最高点位初始构型
2楼2013-10-24 23:30:41
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lyjoy

金虫 (正式写手)

★ ★
gmy1990: 金币+2 2013-11-01 19:51:14
要看你做的什么体系,如果只涉及单个键的成键和断键问题,一般手动调整反应物和产物的构型到你认为最接近过渡态的构型后,固定主反应坐标(内坐标格式)优化,1-2次后放开优化(在主反应坐标后面空格 加“3”)即可
3楼2013-11-01 09:12:49
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limengru

新虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by lyjoy at 2013-11-01 09:12:49
要看你做的什么体系,如果只涉及单个键的成键和断键问题,一般手动调整反应物和产物的构型到你认为最接近过渡态的构型后,固定主反应坐标(内坐标格式)优化,1-2次后放开优化(在主反应坐标后面空格 加“3”)即可

主反映坐标是?是固定哪一部分
4楼2013-11-01 19:47:21
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lkui486

至尊木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

引用回帖:
4楼: Originally posted by limengru at 2013-11-01 19:47:21
主反映坐标是?是固定哪一部分...

就是涉及到成键与断键的原子的坐标啊!

[ 发自小木虫客户端 ]
5楼2013-11-02 11:40:49
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limengru

新虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by lkui486 at 2013-11-02 11:40:49
就是涉及到成键与断键的原子的坐标啊!
...

谢谢啊
6楼2013-11-03 09:32:18
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