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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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kingswordscu

铜虫 (正式写手)


[交流] DMOL3过渡态计算中多反应物初始结构的设置

采用DMOL3计算过渡态时候,如果是2个或者2个以上的反应物,初始结构的放置似乎对结果影响很大,2个分子的靠近方式,应该有多种可能,如何进行选择啊?如何进行合理的初始结构位置,间距,角度直接的放置呢?
这是不是只有靠经验和分析呢, 对于多个反应物,怎么能够更加合理的放置初始结构呢? 我是新手,希望大家给点指导:)
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xrchen66

金虫 (著名写手)


★ ★
kingswordscu(金币+1): 谢谢参与
zh1987hs: 金币+1, 谢谢 2012-08-01 18:49:41
找几个典型的初始结构即可
3楼2012-08-01 17:21:55
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kingswordscu

铜虫 (正式写手)


引用回帖:
3楼: Originally posted by xrchen66 at 2012-08-01 17:21:55
找几个典型的初始结构即可

什么是典型的初始结构啊?
4楼2012-08-01 20:16:18
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kingswordscu

铜虫 (正式写手)


还想问问, dmol3 中 TS Conformaiton 计算出XSD文件中的结构是什么意思呢?
5楼2012-08-02 12:53:43
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未央于一

金虫 (小有名气)


★ ★ ★
kingswordscu(金币+1): 谢谢参与
jiaoyixiong: 金币+2, 新手上路,多鼓励多鼓励 2012-09-28 10:16:39
引用回帖:
5楼: Originally posted by kingswordscu at 2012-08-02 12:53:43
还想问问, dmol3 中 TS Conformaiton 计算出XSD文件中的结构是什么意思呢?

优化后结构的文件,本次计算后的结构文件!这么简单的都不知道,你还算什么劲啊!!!!
6楼2012-09-28 10:08:07
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简单回复
2012-08-01 13:53   回复  
kingswordscu(金币+1): 谢谢参与
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