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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 【求助】怎样固定某个分子（不优化）优化其它分子 ？
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oyljw

至尊木虫 (职业作家)

格物致知Professional

[交流] 【求助】怎样固定某个分子（不优化）优化其它分子 ？

请问：     想优化两个分子之间的相互作用，能把某个分子固
定住（不优化）先优化另一个分子吗？这是冻结核吗？

想固定优化，需要把坐标后面加上0，还需不需要其他的？
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独立之精神自由之思想
1楼2010-10-25 13:09:06
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3867826

木虫 (著名写手)
oyljw(金币+1): 2010-10-25 20:42:24
oyljw(金币+1): 2010-10-26 11:11:34
去看版主的FAQ 上面有！
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拒稿，终于体会到了！乱写接受，认真写拒稿，这就是2和4的区别吗？
4楼2010-10-25 18:45:53
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manson1998

金虫 (著名写手)

OLED达人
oyljw(金币+2):谢谢您的回复 2010-10-25 14:17:57
你直接把另一个分子的所有原子都固定就可以了
赞一下 回复此楼
惺惺相惜情不自禁
2楼2010-10-25 13:21:46
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oyljw

至尊木虫 (职业作家)

格物致知Professional
这是冻结原子不参加优化。
需要把坐标中的原子后面空格之后加上“-1”

例子
C -1  X   Y   Z
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独立之精神自由之思想
3楼2010-10-25 18:37:08
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oyljw

至尊木虫 (职业作家)

格物致知Professional
我看到版主的帖子了
“（3.2）
想固定某部分原子（键长、键角、二面角、相对位置、相对方向。。。。）怎么做？


  Quote:
1.opt=modredundant 命令
在坐标后面写上你要固定的原子序号，例如
1 2 f，限制1-2原子间键长
1 2 3 4 f，限制1-2-3-4原子间二面角
2.使用constants指定，如下例可以固定水的键角105.4度
O
H1 O R
H2 O R H1 A
Variables:
R 1.0
Constants:
A 105.4
3.使用列标记，把直角坐标下的第二列改为-1，则会固定原子坐标，
改为比-1还小的数值，这些被改动的原子间的相对位置固定。 ”

感谢版主和楼上的！
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独立之精神自由之思想
5楼2010-10-26 11:13:42
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