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oyljw至尊木虫 (职业作家)
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[交流]
【求助】怎样固定某个分子（不优化）优化其它分子 ？
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请问： 想优化两个分子之间的相互作用，能把某个分子固 定住（不优化）先优化另一个分子吗？这是冻结核吗？ 想固定优化，需要把坐标后面加上0，还需不需要其他的？ |
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4楼2010-10-25 18:45:53
2楼2010-10-25 13:21:46
oyljw
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3楼2010-10-25 18:37:08
oyljw
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我看到版主的帖子了 “（3.2） 想固定某部分原子（键长、键角、二面角、相对位置、相对方向。。。。）怎么做？ Quote: 1.opt=modredundant 命令 在坐标后面写上你要固定的原子序号，例如 1 2 f，限制1-2原子间键长 1 2 3 4 f，限制1-2-3-4原子间二面角 2.使用constants指定，如下例可以固定水的键角105.4度 O H1 O R H2 O R H1 A Variables: R 1.0 Constants: A 105.4 3.使用列标记，把直角坐标下的第二列改为-1，则会固定原子坐标， 改为比-1还小的数值，这些被改动的原子间的相对位置固定。 ” 感谢版主和楼上的！ |
5楼2010-10-26 11:13:42
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