24小时热门版块排行榜    

查看: 3102  |  回复: 17
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

feitianrenwo

木虫 (著名写手)

[交流] 【求助/交流】求助基因克隆方面的问题解决方案 已有10人参与

求助基因克隆方面的问题解决方案

本人正在克隆一个微生物的一个基因,设计简并引物扩增基因组DNA,获得了几个DNA片段,在NCBI里比对,与一些微生物的同源性达到80%以上,我想知道有了这些DNA片段的序列,如何知道相应的氨基酸序列呢?然后如何得到该基因的全长?(已经知道没有内含子)
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lingn

木虫 (正式写手)

★
feitianrenwo(金币+1):谢谢参与
feitianrenwo(金币+1): 2010-05-16 09:44:15
做RACE吧,如果转录本的量还比较大的话,
好的反转录试剂盒+好的PCR酶
9楼2010-05-15 19:49:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 18 个回答

gastrodia

金虫 (正式写手)

★ ★
scelab(金币+2):欢迎多来交流!:tiger06: 2010-05-14 21:16:19
feitianrenwo(金币+3): 2010-05-15 09:44:05
feitianrenwo(金币+1): 2010-05-16 09:44:38
有了DNA序列如何知道相应的aa氨基酸序列?翻译啊,无论是什么序列,只要是功能基因,那么只有一个阅读框是正确的,你可以正向反向翻译,去掉一个碱基再翻译,去掉两个碱基再翻译,在翻译中不中断的序列即是正确的阅读框,拿翻译的结果去做蛋白质blast
2楼2010-05-14 19:57:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yujiaping1

木虫 (著名写手)

★ ★ ★
scelab(金币+3):热心虫友,欢迎多来交流~~~:tiger06::tiger28::tiger23: 2010-05-14 21:16:28
feitianrenwo(金币+3): 2010-05-15 09:44:14
feitianrenwo(金币+1): 2010-05-16 09:44:35
首先楼主要说明白,获得的片段是从头到尾的,还是只是一部分,就是说楼主要说明白引物是怎么设计的,在什么位置设计的,明确这一点的目的是要知道是否包含完整的阅读框。

如果楼主PCR所用引物比较靠近两端,就是说基本能包含完整的阅读框,那么直接使用NCBI的ORF fineder就可以了,可以直接找到整个开放阅读框,并且翻译出氨基酸序列,包含起始密码子和终止密码子
3楼2010-05-14 20:39:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

feitianrenwo

木虫 (著名写手)

我是根据保守的氨基酸序列设计的简并引物,对基因组DNA扩增获得了一些片段,但是经ORF的finder搜索并没有发现开放阅读框。

我的意思是如何通过这些DNA的序列知道相应的氨基酸序列,然后就是通过什么方法获得基因的全长
4楼2010-05-15 09:52:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[文学芳草园] 厉娜 +3 张丹枫1991 2026-11-09 5/250 2026-11-09 16:53 by 张丹枫1991
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +5 kvewwGtKktqB 2026-11-04 12/600 2026-11-09 13:26 by Equinoxhua
[考研] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 15/750 2026-11-09 13:19 by Equinoxhua
[考研] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +6 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 14/700 2026-11-09 11:52 by GwrQVVR6Oenx
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +5 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 16/800 2026-11-09 11:47 by GwrQVVR6Oenx
[考博] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +5 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 15/750 2026-11-09 11:41 by GwrQVVR6Oenx
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +4 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 10/500 2026-11-09 08:00 by IhnEQauGmT3K
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 12/600 2026-11-09 06:32 by l48hFd8Nwae2
[公派出国] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +4 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 8/400 2026-11-09 00:14 by l48hFd8Nwae2
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 8/400 2026-11-08 23:01 by l48hFd8Nwae2
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +5 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 9/450 2026-11-08 22:46 by l48hFd8Nwae2
[教师之家] 延安大学回应“副教授留绝笔信”:确已离世,正核实举报内容 +3 yexuqing 2026-11-04 5/250 2026-11-07 13:22 by 苏东坡二世
[公派出国] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +6 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 12/600 2026-11-06 16:10 by 5sJFDKp2kwuI
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +4 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 11/550 2026-11-06 16:10 by 5sJFDKp2kwuI
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +5 kvewwGtKktqB 2026-11-04 14/700 2026-11-06 05:10 by qL1cU46YIdK0
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +6 kvewwGtKktqB 2026-11-04 16/800 2026-11-06 05:00 by qL1cU46YIdK0
[考博] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 7/350 2026-11-06 02:13 by qL1cU46YIdK0
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 10/500 2026-11-06 02:04 by qL1cU46YIdK0
[硕博家园] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 9/450 2026-11-06 02:02 by qL1cU46YIdK0
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 hNpp4Y2CGvSC 2026-11-04 12/600 2026-11-06 01:53 by qL1cU46YIdK0
信息提示
请填处理意见