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feitianrenwo

木虫 (著名写手)

[交流] 【求助/交流】求助基因克隆方面的问题解决方案 已有10人参与

求助基因克隆方面的问题解决方案

本人正在克隆一个微生物的一个基因,设计简并引物扩增基因组DNA,获得了几个DNA片段,在NCBI里比对,与一些微生物的同源性达到80%以上,我想知道有了这些DNA片段的序列,如何知道相应的氨基酸序列呢?然后如何得到该基因的全长?(已经知道没有内含子)
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yujiaping1

木虫 (著名写手)

★ ★ ★
scelab(金币+3):热心虫友,欢迎多来交流~~~:tiger06::tiger28::tiger23: 2010-05-14 21:16:28
feitianrenwo(金币+3): 2010-05-15 09:44:14
feitianrenwo(金币+1): 2010-05-16 09:44:35
首先楼主要说明白,获得的片段是从头到尾的,还是只是一部分,就是说楼主要说明白引物是怎么设计的,在什么位置设计的,明确这一点的目的是要知道是否包含完整的阅读框。

如果楼主PCR所用引物比较靠近两端,就是说基本能包含完整的阅读框,那么直接使用NCBI的ORF fineder就可以了,可以直接找到整个开放阅读框,并且翻译出氨基酸序列,包含起始密码子和终止密码子
3楼2010-05-14 20:39:21
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