qPCR检测限为什么不是拷贝数/反应,而是拷贝数/mL
目前看到的关于新冠等核酸检测试剂盒标明的检测限都是“拷贝数/mL”,这是怎么测出来的,看了很多文章都说是利用已知浓度的病毒颗粒或质粒十倍稀释后看最低能检测到的拷贝数,并没有写明详细做法。不理解的是,为什么检测限不以“拷贝数/反应”来表示,比如1000拷贝/mL的样品1mL,模板加10μL和1μL肯定是不一样的,所以这个1000拷贝/mL表示一个反应能检测到多少呢。如果我们自己设计qPCR反应,检测限应该达到多少个拷贝/反应才是合适的呢,自己做实验的时候500个拷贝/反应的ct值就已经36了,是哪里的问题呢
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另外,如果这1ml(100cp/ml)的样本全部提取,然后用50ul洗脱,假设蒸发后剩30,上样20ul的话,这样计算下来每个反应是20-50cp/PCR,那么是不是也可以宣称这个试剂检测下限是100cp/ml 呢,这岂不是有点乱套
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我自己做Taqman方法的,基本都在3~4 cp/PCR,100~1000cp/ml的水平,取决于提取体系、扩增体系的大小。
不乱套,以cp/ml计算,只管你样本初始浓度,评估的是整套提取+扩增的性能,检出限只要你保证95%以上检出率就行。我之前做HBV检测,600多上样量,做到2 IU/ml(<12cp/ml,3cp/PCR)就这么做的。
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