分离了一些肠球菌,27F和1492R引物对扩增测序后,发现它们的序列信息很相似,很多只在序列的首尾部分有一些不同碱基,请教一下它们会是同一株菌吗?非常感谢! 返回小木虫查看更多
将16S测序结果去掉头尾峰值较差的碱基后,将你测得的几株菌序列在NCBI中进行两两比对,看一下相似性到底有多高,如果相似性在99%以上,那证实是同一个种。在这个前提下,如果同一个样品、同一种培养基上挑取纯化的菌落,基本上可以证实是同一株菌;但如果是在不同样品、不同分离培养基下挑取的菌株,即使相似性是在99%以上,也只能证实是同一个种,但不能证实是同一株菌。如果想进一步证实是否是同一株菌,就要将这几株菌在同等条件下,一起进行生理生化实验,如果生理生化实验相同,可以证实是同一株菌,
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将16S测序结果去掉头尾峰值较差的碱基后,将你测得的几株菌序列在NCBI中进行两两比对,看一下相似性到底有多高,如果相似性在99%以上,那证实是同一个种。在这个前提下,如果同一个样品、同一种培养基上挑取纯化的菌落,基本上可以证实是同一株菌;但如果是在不同样品、不同分离培养基下挑取的菌株,即使相似性是在99%以上,也只能证实是同一个种,但不能证实是同一株菌。如果想进一步证实是否是同一株菌,就要将这几株菌在同等条件下,一起进行生理生化实验,如果生理生化实验相同,可以证实是同一株菌,
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