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诚心请教：两株菌的16S测序结果很相似，可以算是同一株菌吗？谢谢！

分离了一些肠球菌，27F和1492R引物对扩增测序后，发现它们的序列信息很相似，很多只在序列的首尾部分有一些不同碱基，请教一下它们会是同一株菌吗？非常感谢！返回小木虫查看更多

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pansyg12

不是可以把序列拿去NCBI里比对
嘟嘟熊levi

看你的实验目的，单单只是做一个鉴定，NCBI中去比对就好了，看得分和相似性。如果要是论文中的一部分数据，还要建树，还有其他的形态和生理生化鉴定。
zengjiarui

引用回帖:
2楼: Originally posted by pansyg12 at 2021-01-08 16:47:36
不是可以把序列拿去NCBI里比对

已经在NCBI里比对过了，大概可以确认种属，只是不知道我得到的那几株菌，会不会其实是同一株？
zengjiarui

引用回帖:
3楼: Originally posted by 嘟嘟熊levi at 2021-01-08 20:19:36
看你的实验目的，单单只是做一个鉴定，NCBI中去比对就好了，看得分和相似性。如果要是论文中的一部分数据，还要建树，还有其他的形态和生理生化鉴定。

其实主要问题不是鉴定种属，而是想确认一下，分离得到的那几株菌，会不会其实是同一株？毕竟它们的16S序列很相似
，
doukezhiwu

建议再做其他持家基因的序列扩增和测序，更容易确定是否同意菌株。
独登楼倚栏

16S一致度多高？可以做形态、生理生化指标的一些分析