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sgRNA设计请教

作者 Endeavour__
来源: 小木虫 250 5 举报帖子
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CRISPR新手。
已知 sgTelomere-GTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTA。 怎么设计完整的 sgRNA的完整序列?有没有相关文献?我只查到这个靶向序列,但PAM等是怎样的呢?有没有直接的文献? 返回小木虫查看更多

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  • 精华评论
  • 泡沫12

    PAM位点,就是NGG序列,N代表任何一种核苷酸,合成的gRNA不能包括NGG

  • fuyuandj86

    引物设计方法取决于你用的载体质粒
    最常用的是张峰的plenti-crispr体系,克隆这个sgRNA质粒对应的载体设计请看以下链接的说明书:
    https://media.addgene.org/data/p ... nt_B3xTwla0bkYD.pdf

  • Endeavour__

    引用回帖:
    4楼: Originally posted by fuyuandj86 at 2020-10-21 10:33:49
    引物设计方法取决于你用的载体质粒
    最常用的是张峰的plenti-crispr体系,克隆这个sgRNA质粒对应的载体设计请看以下链接的说明书:
    https://media.addgene.org/data/plasmids/52/52961/52961-attachment_B3xTwla0b ...

    试剂盒与质粒合成合成出来的序列完全一致吗? 试剂盒合成的序列也具有 S. pyogenes terminator序列吗

  • Endeavour__

    引用回帖:
    3楼: Originally posted by 泡沫12 at 2020-10-18 16:42:34
    PAM位点,就是NGG序列,N代表任何一种核苷酸,合成的gRNA不能包括NGG

    试剂盒与质粒合成合成出来的序列完全一致吗? 试剂盒合成的序列也具有 S. pyogenes terminator序列吗?

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