怎么在NCBI或者其他软件上分析LAMP引物序列本身的特异性？ 返回小木虫查看更多
可以在primer blast里面输入自己的外引物试试，但是内引物太长了，好像不行
可以Bowtie比对一下
我对于FIP/BIP是采用就是设计的时候接起来的方法把它单独分开来，通过NCBI的Primer Blast的里面进行一个nr的blast，然后看引物的单独的特异性好不好。因为LAMP是2对引物共同作用，如果引物只要有一个存在问题，那么扩增就会存在很大问题，所以说从引物的作用角度来分析我觉得好像特异性蛮高。但是容易出现假阳性扩增，这点是不是又可以说引物本身特异性不好？ 还希望有大佬看到给我个回复，小弟才初入LAMP，很多东西还不是很懂~~
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可以在primer blast里面输入自己的外引物试试，但是内引物太长了，好像不行
可以Bowtie比对一下
bowtie可以针对FIP/BIP进行直接分析吗？FIP/BIP的设计不是通过2段接到一起的吗？还是说需要分开进行单独分析？
我对于FIP/BIP是采用就是设计的时候接起来的方法把它单独分开来，通过NCBI的Primer Blast的里面进行一个nr的blast，然后看引物的单独的特异性好不好。因为LAMP是2对引物共同作用，如果引物只要有一个存在问题，那么扩增就会存在很大问题，所以说从引物的作用角度来分析我觉得好像特异性蛮高。但是容易出现假阳性扩增，这点是不是又可以说引物本身特异性不好？
还希望有大佬看到给我个回复，小弟才初入LAMP，很多东西还不是很懂~~
请问有解决方法了吗
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