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求助生物专业虫友:详细查询蛋白二级结构的方法

作者 hsd3521
来源: 小木虫 550 11 举报帖子
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我做了红外,并对改蛋白的二级结构进行了分析,现在想在数据库中进行比对,但是在PDB等数据库中看到的是该种蛋白的三级结构,所以特向虫友请教如何查找特定蛋白的二级结构(螺旋、折叠等信息),因为非生物学专业,烦请详细指教,谢谢 返回小木虫查看更多

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  • 精华评论
  • hsd3521

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  • hellen1987

    红外做好了,在1600-1700波段不是代表的是蛋白质二级结构的信息吗?然后对图谱进行去卷积和二阶导师求导,然后再peakfit或者origin中对峰进行拟合和百分比分析,就得到各二级结构所占的比例

  • hsd3521

    引用回帖:
    10楼: Originally posted by hellen1987 at 2013-01-25 18:12:09
    红外做好了,在1600-1700波段不是代表的是蛋白质二级结构的信息吗?然后对图谱进行去卷积和二阶导师求导,然后再peakfit或者origin中对峰进行拟合和百分比分析,就得到各二级结构所占的比例

    是的  这个已经做完了 我还需要做对比 所以在查数据库

  • wizardfan

    引用回帖:
    9楼: Originally posted by hsd3521 at 2013-01-25 18:04:23
    比如这个,我不知道如何换算百分含量

    QQ截图20130125180211.jpg
    ...

    helix% = the total count of AAs which are predicted to form helices / the total number of all AAs

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