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求助生物专业虫友：详细查询蛋白二级结构的方法

我做了红外，并对改蛋白的二级结构进行了分析，现在想在数据库中进行比对，但是在PDB等数据库中看到的是该种蛋白的三级结构，所以特向虫友请教如何查找特定蛋白的二级结构（螺旋、折叠等信息），因为非生物学专业，烦请详细指教，谢谢返回小木虫查看更多

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cicelyzh

https://au.expasy.org/tools/里面有蛋白质二级结构预测的
zhang881007

zhou-Fassman 方法是用于判断二级结构的方法，zhou，是中国人，邹承鲁先生
hsd3521

引用回帖:
3楼: Originally posted by zhang881007 at 2013-01-25 08:58:44
zhou-Fassman 方法是用于判断二级结构的方法，zhou，是中国人，邹承鲁先生

非常感谢您的帮助，我已经按照这个方法做了二级结构预测，但是如何得到比如螺旋、折叠等二级结构所占的比例那？请指教，谢谢
hsd3521

引用回帖:
3楼: Originally posted by zhang881007 at 2013-01-25 08:58:44
zhou-Fassman 方法是用于判断二级结构的方法，zhou，是中国人，邹承鲁先生

比如说这个结果
Total Residues: H: 579 E: 484 T: 127
Percent: H: 58.6 E: 49.0 T: 12.9
为什么没有无规卷曲的比例
另外这个百分率是大于100的
，
wizardfan

interpro是个综合性的蛋白质数据库，集成了很多二级结构数据库，比如pfam, prints 。。。
EMBOSS是个免费的生物信息软件包，里面也有很多预测二级结构的软件
hsd3521

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hsd3521

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