拿到DNA基因序列怎样分析其外显子内含子及开放阅读框呢？请各位大侠帮忙啊，谢谢 返回小木虫查看更多
利用Softberry (http://linux1.softberry.com/berry.phtml)的Gene Finding工具在线分析即可
可以利用gene bank比较DNA序列和mRNA序列，一般就可以得到外显子区域和内含子区域。
ORF Finder (Open Reading Frame Finder) http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gorf/gorf.html
ORF finder是你输入的是cDNA的序列，他会帮你找出来，expasy网站的那个工具比ncbi的好用，只要找出编码最长氨基酸序列的那种阅读框就行了，你现在是基因组序列，用ncbi blast一下，找到mRNA的序列，再分析外显子内含子就比较容易了
学习一下！
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利用Softberry (http://linux1.softberry.com/berry.phtml)的Gene Finding工具在线分析即可
可以利用gene bank比较DNA序列和mRNA序列，一般就可以得到外显子区域和内含子区域。
ORF Finder (Open Reading Frame Finder)
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gorf/gorf.html
ORF finder是你输入的是cDNA的序列，他会帮你找出来，expasy网站的那个工具比ncbi的好用，只要找出编码最长氨基酸序列的那种阅读框就行了，你现在是基因组序列，用ncbi blast一下，找到mRNA的序列，再分析外显子内含子就比较容易了
和谁blast？ 具体blast操作能说一下么
学习一下！
这个网站，打开把你序列贴进去，然后查看检索结果，运气好的话，可能会有你基因的参考序列，参考序列标记：NM_开头
http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Bl ... ;LINK_LOC=blasthome
[ Last edited by gyesang on 2009-10-7 at 10:09 ]
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