紧急求助:有没有大神指导下如何将fch文件转cub进而用GV查看表面电子云分布。能给具体步骤最好,非常感谢 返回小木虫查看更多
百度上能找到如何看分子的HOMO和LOMO轨道,不知道对你有没有用。我也在尝试学这方面的东西,有点不懂
可以用gview打开 fchk 之后再右键 选择 rusults---surface/contour--右上角的cube actions里选择 new cube就能生成 你想要的cube 看电子云分布 那就用 total density就可以。除此之外也可以plot 不同分子轨道的样子 等等。 也可用 gauss软件生成cube。linux下用cubegen 命令就行。输入类似 cubegen 8 density 1.fchk 1.cube 0 就可以。 8 代表计算生成cube所需要用的cpu核心数 ;density代表需要生成的cube包含的信息。这里是 电子密度 density; 0 代表用默认格点数 (80)^3;
百度上能找到如何看分子的HOMO和LOMO轨道,不知道对你有没有用。我也在尝试学这方面的东西,有点不懂
可以用gview打开 fchk 之后再右键 选择 rusults---surface/contour--右上角的cube actions里选择 new cube就能生成 你想要的cube 看电子云分布 那就用 total density就可以。除此之外也可以plot 不同分子轨道的样子 等等。
也可用 gauss软件生成cube。linux下用cubegen 命令就行。输入类似 cubegen 8 density 1.fchk 1.cube 0 就可以。 8 代表计算生成cube所需要用的cpu核心数 ;density代表需要生成的cube包含的信息。这里是 电子密度 density; 0 代表用默认格点数 (80)^3;
用linux版的Gauss生成 cube的方法 就是我之前回帖第二段里说的 cubegen命令 就是通过fchk 生成cube. 而且你得确定知道要生成那种cube才行。我不确定你所说的表面电子云分布指的是什么图 能不能给一个例子看看?
windows版gauss生成 cube的方法:进入G09w所在文件夹 找到一个叫cubegen.exe 的文件 双击 就会弹出一个dos窗口
首先问你需要生成什么样的cube 可以是 Density 电子密度 也可以是其它的 就看你需要生成什么。
确认之后 就是要输入fchk文件的文件名。我一般是把要转换的fchk直接放在G09w的这个文件夹下 直接打文件名就行了 不需要路径。
然后会问你要生成的cube文件的名字。
之后两个选项直接回车默认就行了。
都确认输入后 点回车 过一会 cube'就会生成了。
操作的截图我已经放在附件里了。
TIM截图20190422221955.png
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