测了几株细菌的基因组框架图(草图),如何利用这些数据把细菌确定到种水平?在NCBI上用不同的数据库进行Blast,结果不太一样。请专家指教一下,谢谢啦 返回小木虫查看更多
这个需要系列的流程,先比较16S rRNA,再比较基因组,
可以,
做平均核苷酸相似度(ANI)分析,如果ANI值与已知种的相似度高于95%,即可确定为同种!可以参考http://imedea.uib-csic.es/jspecies/about.html
这个需要系列的流程,先比较16S rRNA,再比较基因组,
请问可以加qq吗?
可以,
做平均核苷酸相似度(ANI)分析,如果ANI值与已知种的相似度高于95%,即可确定为同种!可以参考http://imedea.uib-csic.es/jspecies/about.html
好的,谢谢啦
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