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张锋老师的文章Nucleic acid detection with CRISPR-Cas13a/C2c2的疑问

作者 王浩wanghao
来源: 小木虫 300 6 举报帖子
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请问张锋老师文章Nucleic acid detection with CRISPR-Cas13a/C2c2中的Fig.4B中的crRNA ratio是什么含义,还请看过文章的同学不吝赐教

张锋老师的文章Nucleic acid detection with CRISPR-Cas13a/C2c2的疑问
Fig.4A和4B.jpg 返回小木虫查看更多

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  • 精华评论
  • snoopytbw

    非编码RNA啊,分很多中,其中cirRNA是中间的一种啊,这个应该是算的比例呗。。。

  • 王浩wanghao

    引用回帖:
    2楼: Originally posted by snoopytbw at 2018-08-24 08:49:36
    非编码RNA啊,分很多中,其中cirRNA是中间的一种啊,这个应该是算的比例呗。。。

    不是的,除了拼写上不同,crRNA是指cas13a的向导RNA,用来结合靶基因从而使得cas13a能特异性切割靶序列

  • 王浩wanghao

    引用回帖:
    4楼: Originally posted by snoopytbw at 2018-08-24 14:38:44
    这篇我也看过,不太记得细节了,我猜是看的前导g成功编码的cirRNA比例吧,其余的贡献给了脱靶效应,大概是这个意思。证明该方法可以有效进行编辑吧,欢迎指正
    ...

    这是补充材料里的解释,跟环状RNA没关系的
    张锋老师的文章Nucleic acid detection with CRISPR-Cas13a/C2c2的疑问-1
    crRNA ratio.jpg


  • 王浩wanghao

    引用回帖:
    5楼: Originally posted by snoopytbw at 2018-08-24 14:39:47
    crRNA的确不是circRNA,我写错了
    ...

    所以这个问题解决了,但是还有一个问题:crRNA识别靶序列是通过碱基互补配对的方式,但是在图中却不是这样。比如B中第一个图中allele1一列中的SNP(A,G),应该与下面检测她的crRNA互补,但下面的crRNA仍是A,G,不应该是T,C吗

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