单位统一就好了吧？

理论上哪个单位都行啊，反正是相互换算的关系。
具体对于你说的金属，lj, 用最common的 units metal就好啦~

你应该仔细阅读手册上的units章节，单位只是为了压缩数字存储的大小，不至于动不动-10次方-20次方几十位小数，在c++中会这用到长双精度类型甚至位数不够以至于运算容易出错。在我的印象中除了lj以外，就是metal和real单位最为实用，理论上，正如楼上所说的，只要单位统一，你可以用任何一种单位，但是做真实系统，转换成lj是很不方便的，常常用metal或者real。最重要的一点是，你用的势函数很有可能是带有单位的，你应该查看势函数每个参数的说明以及常用例子使用的单位，比如eam，可能有十几到二十多个参数，手册上会标明它们各自的默认单位，你如果对一个metal的势函数用了real单位，那里面的所有energy单位(因为metal和real最大的差别只是energy单位不同)，软件是不会转换的，lammps会把一个kcal/mol的能量当成eV计算。所以在使用不同的单位之前，你要自己改势函数文件，把单位换算过来。不要问我怎么知道的

，