我打算做一下土壤微生物的群落多样性,打算用DGGE来做,但是好像现在流行高通量基因测序。请教各位大神DGGE是否已经落伍了,它和高通量测序个油什么优缺点?谢谢指教! 返回小木虫查看更多
以细菌16S为例, DGGE是对样本抽提DNA,通过跑胶,看条带,割条带,测条带的序列,与数据库进行比对,得出结果;根据条带的亮、弱,人为选择后续所测的条带。 高通量是通过对样本进行提DNA,对16S单V区或双V区进行测序,测得的序列与数据库进行比对,得出结果。 2、3年之前用DGGE的多,现在用高通量的多。 但不一定DGGE落伍,有一个客户,用DGGE发了篇5.多的文章。 最主要的还是文章的所阐述的问题和创新性,
以细菌16S为例,
DGGE是对样本抽提DNA,通过跑胶,看条带,割条带,测条带的序列,与数据库进行比对,得出结果;根据条带的亮、弱,人为选择后续所测的条带。
高通量是通过对样本进行提DNA,对16S单V区或双V区进行测序,测得的序列与数据库进行比对,得出结果。
2、3年之前用DGGE的多,现在用高通量的多。
但不一定DGGE落伍,有一个客户,用DGGE发了篇5.多的文章。
最主要的还是文章的所阐述的问题和创新性,