粉碎后也不一样？

受热时间不一样吧

但从干燥工艺讲，GMP指南推荐使用流化干燥进行干燥，两种工艺基本不存在区别，如果是颜色产生了变化，只能从干燥温度上进行分析：
烘箱干燥过程中，产品为静态分布在托盘内，表面产品接触热风的时间长（多度干燥），不知楼主烘箱干燥的产品，是否存在表面产品颜色深，底部产品颜色相对较浅的情况？如果存在，就是烘箱内产品表面过度干燥，而流化床内的产品为均匀干燥，所以产品颜色会相对较浅。干燥后产品的性质应该基本相同。