膜蛋白通过TMHMM预测怎么没有跨膜区啊? 返回小木虫查看更多
本人刚刚读研,想请教楼主TMHMM是什么,怎么用啊,谢谢了
TMHMM是预测蛋白质跨膜螺旋的软件 预测有一定的准确度,而且主要根据氨基酸序列,如果你的蛋白的氨基酸序列的疏水性不是很强的,也有可能预测不出来。 还有就是膜蛋白也不一定都是跨膜的螺旋 可以是跨膜的beta桶 也可以是膜锚定,或者螺旋同膜的一侧有结合,这些个情况都是有可能的
虽然我也不是很懂 但是最近也找过几个工具预测跨膜区的 你可以试试哈~毕竟是预测,不同工具算出来的也是不完全相同就是 http://www.ebi.ac.uk/Tools/pfa/iprscan/ https://www.predictprotein.org/,
本人刚刚读研,想请教楼主TMHMM是什么,怎么用啊,谢谢了
TMHMM是预测蛋白质跨膜螺旋的软件
预测有一定的准确度,而且主要根据氨基酸序列,如果你的蛋白的氨基酸序列的疏水性不是很强的,也有可能预测不出来。
还有就是膜蛋白也不一定都是跨膜的螺旋
可以是跨膜的beta桶
也可以是膜锚定,或者螺旋同膜的一侧有结合,这些个情况都是有可能的
虽然我也不是很懂 但是最近也找过几个工具预测跨膜区的
你可以试试哈~毕竟是预测,不同工具算出来的也是不完全相同就是
http://www.ebi.ac.uk/Tools/pfa/iprscan/
https://www.predictprotein.org/,
如果是β桶用什么软件预测