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膜蛋白通过TMHMM预测怎么没有跨膜区啊

作者 liuqingrui5
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  • 精华评论
  • wodehao110

    本人刚刚读研,想请教楼主TMHMM是什么,怎么用啊,谢谢了

  • woolley

    TMHMM是预测蛋白质跨膜螺旋的软件
    预测有一定的准确度,而且主要根据氨基酸序列,如果你的蛋白的氨基酸序列的疏水性不是很强的,也有可能预测不出来。
    还有就是膜蛋白也不一定都是跨膜的螺旋
    可以是跨膜的beta桶
    也可以是膜锚定,或者螺旋同膜的一侧有结合,这些个情况都是有可能的

  • jenny6803

    虽然我也不是很懂   但是最近也找过几个工具预测跨膜区的
    你可以试试哈~毕竟是预测,不同工具算出来的也是不完全相同就是
    http://www.ebi.ac.uk/Tools/pfa/iprscan/
    https://www.predictprotein.org/

  • mike45

    引用回帖:
    3楼: Originally posted by woolley at 2014-03-10 11:40:35
    TMHMM是预测蛋白质跨膜螺旋的软件
    预测有一定的准确度,而且主要根据氨基酸序列,如果你的蛋白的氨基酸序列的疏水性不是很强的,也有可能预测不出来。
    还有就是膜蛋白也不一定都是跨膜的螺旋
    可以是跨膜的beta桶 ...

    如果是β桶用什么软件预测

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