酿酒酵母同源重组问题求助
本人是一名研一学生,从11月份接触酵母同源重组已经快4个月了,可一直失败。
我所用的菌种为BY4741,同源臂长度为60bp,用的loxp/cre系统。抗性筛选用的G418,浓度为400mg/L。每次筛选得到的都是假阳性的菌种,可我的阴性对照板上一个也不长(阴性对照我采用的是转入一段大小相似的没有抗性的基因),这证明我的敲除组件还是转进去了,使得菌种携带有抗性,可为什么验证不出来呢?难道存在敲除组件转进去但没有重组成功这种可能吗?抗性板上长出来的菌都特别小,不是正常的状态。跪求高手指点迷津。
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今日热帖
同源臂有些短建议提高到200-400bp,会比较容易了。
g418就是容易假阳性,换潮霉素抗性质粒就好了
酿酒酵母一般所用同源臂为30-60bp,我参考的文献用的是60bp做出来了,只是他们用的是SCY876这个型号的酿酒酵母菌。想问一下您
1、同属于酿酒酵母菌,因为遗传背景的不同,所需的同源臂长度也不一样吗?
2、您说的同源臂提高到200-400bp是用的两步法敲除吗?我现在用的一步法敲除,在设计敲除组件引物是60bp同源臂+20bploxp上下游,引物的费用已经高达400元了,求大神解惑
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涂布太密也会导致菌落长不大,你都验证了菌落都是假阳性?没有目的基因?
你整合的片段是多长的?你现在实验成功了吗?
我现在利用CRISPR很容易将外源基因整合到酵母, 不知道是不是多此一举,收到信息请回复,希望和你讨论一下, 我的QQ2817518626