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【讨论】关于静电势图的描述

作者 vigaryang
来源: 小木虫 550 11 举报帖子
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对一个分子进行静电势计算后会得到一个彩色的图,红色的为负,蓝色的为正。在写论文时,该如何叙述这个红色和蓝色的准确含义?假定分子结构中区域A的红色最深,那么这说明区域A是“负电荷密度最高”呢,还是“带负电较多”,还是“负电荷集中”,还是“负电集中”,还是其它? 谢谢。 返回小木虫查看更多

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  • 精华评论
  • zhou2009

    电子密度等值面上的电子密度自然是相等的。

    但在静电势的等值面图,因为有了负值,作的等值面是分别作的正负值,它们可以是绝对值相等,但一正、一负。正值处电子密度高,负值处电子密度低。

    你说“红色最深的地方是否就只能说明该区域中电子的能级最高,或者该区域中电子与核的距离最远? ”是这样的。而且该区域中电子的密度最低,逄松。

    电子密度只是指定的一个体积微元出现电子的概率大小,并不表示在一个空间或一个原子的实际电荷量。电子密度低,并不表明一个原子的电荷量低;甚至是电荷量高,才导致电子密度低。电子密度低,但它在空间的分布更大,可能总加起来的电荷反而多。这都要具体分析。

  • vigaryang

    引用回帖:
    Originally posted by zhou2009 at 2010-08-03 09:21:52:
    电子密度等值面上的电子密度自然是相等的。

    但在静电势的等值面图,因为有了负值,作的等值面是分别作的正负值,它们可以是绝对值相等,但一正、一负。正值处电子密度高,负值处电子密度低。

    你说“红色最深 ...

    您说的”静电势的等值面图“是怎么一回事呢?通常在gaussview中作出来的静电势图似乎都是电子密度相等而静电势不等?例如某文献中的静电势图的标注为:
    ”B3LYP/6-31++GACHTUNGTRENUNG(d,p) electrostatic potential mapped onto the 0.0004 density isosurface for the ...”
    小木虫上以前有份“分子静电势的物理意义与图形表达”资料中所演示的静电势绘制方法也是从total density到generate values only at surface points, 而且“isovalues for new surfaces=0.0004"

  • lcl19870223

    高斯怎么计算分子静电势能图?

  • 日沐晨

    红色区域表示的是富电子区域,具有亲电活性,蓝色区域为缺电子区域,具有亲核活性,区域为红色,静电势为负值,即带正电荷的微粒与其有较强的相互作用,与之容易靠近;反之,蓝色区域静电势较大,带负电荷的微粒容易靠近。

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