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JULIA606

新虫 (小有名气)

[求助] PCR后琼脂糖凝胶电泳的胶浓度与DNA ladder 大小有什么关系呢? 已有7人参与

各位大侠,新手最近因实验需要基因鉴定进行PCR后电泳,目的基因在290-370bp之间,目前用的100bp ladder,1%琼脂糖,跑了几次后发现 ladder在目的段跑的不是很开,区分不大,不知道琼脂糖凝胶电泳的胶浓度与DNA ladder 大小有什么关系呢?鉴于经验有限,再次请教各位,期待大家的建议与指导~~!~O(∩_∩)O~
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oliviashane

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

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6?: Originally posted by JULIA606 at 2015-12-16 22:07:24
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10楼2015-12-17 01:49:42
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z631535213

木虫 (正式写手)

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我PCR产物长度为180bp左右,选用的Mark为50bp。胶用的2.5%,电压一般是按电极丝之间的距离来算。加热之前连瓶子带溶液称重一次,加热溶解结束后在称重,补水至原重量。加热的时候用保鲜膜密封单层,然后用移液枪头在保鲜膜上扎洞保持和外界大气压相通

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12楼2015-12-17 07:03:30
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oliviashane

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


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myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰,手有余香,分子生物期待您更多精彩。 2015-12-17 15:03:02
膠的?舛扰c目的基因的大小有關,bp數大的用?舛鹊偷哪z跑,阻力小跑的快,反之bp數小的就用高?舛鹊哪z,跑得慢,條帶分離的清楚。

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2楼2015-12-16 01:44:37
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JULIA606

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by oliviashane at 2015-12-16 01:44:37
膠的?舛扰c目的基因的大小有關,bp數大的用?舛鹊偷哪z跑,阻力小跑的快,反之bp數小的就用高?舛鹊哪z,跑得慢,條帶分離的清楚。

打算试试不同浓度的胶跑跑ladder看
3楼2015-12-16 08:44:16
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Heao_

新虫 (初入文坛)

4楼2015-12-16 11:09:46
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JULIA606

新虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by Heao_ at 2015-12-16 11:09:46
我觉得换个电压试试看

Protocol上给的是120V 1h,我都是跑了50min左右,查了一些说法是:根据正负极间的距离5-8V/cm,但是不明白的地方是这个距离是指垂直距离还是直线距离呢。。。我用的电泳槽正负极间的垂直距离12cm+。查看说是跑的慢条带会比较清楚好看。
5楼2015-12-16 22:03:26
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JULIA606

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by oliviashane at 2015-12-16 01:44:37
膠的?舛扰c目的基因的大小有關,bp數大的用?舛鹊偷哪z跑,阻力小跑的快,反之bp數小的就用高?舛鹊哪z,跑得慢,條帶分離的清楚。

今天有用2.5%琼脂糖做胶,但微波至透明太后感觉还是有点粘稠。。在溶琼脂的过程中是用一次性手套套着皮筋在100ml烧杯上,含1*TAE100ml, 溶了后琼脂糖体积会有减少,其浓度也会更浓吧?这个问题如何解决比较好?
6楼2015-12-16 22:07:24
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暮色西荷

铁虫 (小有名气)

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myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰,手有余香,分子生物期待您更多精彩。 2015-12-17 15:02:28
maker的大小是固定的,与胶浓度没有关系;maker跑不开可以多跑会或者换浓度大的胶

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7楼2015-12-16 22:56:35
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蓝莓好吃吗87

铁虫 (正式写手)

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myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰,手有余香,分子生物期待您更多精彩。 2015-12-17 15:02:40
多跑会,稍微加大浓度,制胶过程规范点

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8楼2015-12-16 23:10:12
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shanyue00

铁杆木虫 (著名写手)

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myprayer: 金币+1, 鼓励发帖积极交流。 2015-12-17 15:03:10
可以用4%的胶试试,他可以把150bp和130左右的bp分开

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耐心说话,好好说话!
9楼2015-12-16 23:12:05
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