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赵红霞铁杆木虫 (著名写手)
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Gromacs 溶剂可及表面(SAS)的计算源代码 已有1人参与
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我在MS里计算的轨迹想在VMD里算亲水和疏水部分的溶剂可及表面(SAS) 现在遇到的问题是,在VMD里可以用measure sasa命令算整个分子的SAS,但是没法算各个部分对于SAS的贡献。就像gromacs里那样。 所以,我想看下gromacs里如何实现这一过程,却不知道在哪里查看源代码,请各位熟悉gromacs的帮忙 另,在VMD里如何算出各个部分对于SAS的贡献? 或者谁知道如何将MS里的轨迹转化为pdb格式,这样我就可以在Gromacs里分析了。把xtd另存为pdb只能存当前帧构象,不是轨迹。 |
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8楼2015-09-25 09:09:49
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3楼2015-09-17 11:11:15
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4楼2015-09-21 09:22:37












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