24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 691  |  回复: 4

huyingdamon

银虫 (小有名气)


[求助] 其他溶剂

gromacs中有水溶剂,我想用乙腈之类的溶剂,这个溶剂应该怎么做呢,我已经有了乙腈的gro文件,由prodrg生成,可是这只有一个乙腈分子的结构文件啊
请大家帮帮忙哈
感激不尽啊
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fhh2626

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
huyingdamon: 金币+5 2013-07-15 17:57:34
VMD的auto solvation box插件里面有个use nonstandard solvent
2楼2013-07-15 01:21:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

huyingdamon

银虫 (小有名气)


引用回帖:
2楼: Originally posted by fhh2626 at 2013-07-15 01:21:51
VMD的auto solvation box插件里面有个use nonstandard solvent

谢谢哈 不过具体怎么为我所用啊,能详细的说下吗 谢谢了
3楼2013-07-15 17:58:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fhh2626

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by huyingdamon at 2013-07-15 17:58:37
谢谢哈 不过具体怎么为我所用啊,能详细的说下吗 谢谢了...

你下一个VMD看到界面应该就会用了吧

不过这个只能处理PDB和PSF文件,可能要转换成GROMACS的格式
4楼2013-07-15 21:48:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

huyingdamon

银虫 (小有名气)


引用回帖:
4楼: Originally posted by fhh2626 at 2013-07-15 21:48:06
你下一个VMD看到界面应该就会用了吧

不过这个只能处理PDB和PSF文件,可能要转换成GROMACS的格式...

谢谢了 我再研究下 还是不知道
5楼2013-07-16 19:52:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 huyingdamon 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 ky2p12rrjj 2026-05-15 4/200 2026-05-17 00:57 by ue3ir18jc3
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 x0mp7owy2b 2026-05-15 4/200 2026-05-17 00:35 by ue3ir18jc3
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +5 v9tggjlwd0 2026-05-15 5/250 2026-05-17 00:32 by xiangfeng
[基金申请] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 v9tggjlwd0 2026-05-15 4/200 2026-05-17 00:10 by ue3ir18jc3
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 xx7gd5zq4e 2026-05-15 5/250 2026-05-16 23:57 by ue3ir18jc3
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 l7k6xnh0yc 2026-05-14 4/200 2026-05-16 23:10 by ue3ir18jc3
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +5 l7k6xnh0yc 2026-05-14 5/250 2026-05-16 23:05 by ue3ir18jc3
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +5 l7k6xnh0yc 2026-05-14 6/300 2026-05-16 22:55 by ue3ir18jc3
[考博] 现在不知道怎么办,感觉很痛苦 +5 qweww 2026-05-11 6/300 2026-05-16 19:57 by Equinoxhua
[基金申请] 请问大佬b0816评完了吗 +4 市民华南虎 2026-05-12 8/400 2026-05-16 19:54 by Equinoxhua
[考博] 光量子物理方向 博士招生 1人(2026.09) +3 sandyworld 2026-05-15 3/150 2026-05-16 17:11 by zznnnj
[硕博家园] 考博自荐 +3 科研狗111 2026-05-13 4/200 2026-05-16 11:45 by 科研狗111
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 cjf4bx70cj 2026-05-14 6/300 2026-05-16 11:16 by h3oerqvkv9
[硕博家园] 申请博士 +3 呃?呃 2026-05-15 3/150 2026-05-16 11:01 by a4742549
[教师之家] 上海大学实验技术岗位非升即走 +5 嘻嘻哈哈乐呵呵 2026-05-15 5/250 2026-05-16 00:17 by caiyun
[考博] 西南大学考核制博士 +4 lijunjie84 2026-05-11 7/350 2026-05-15 23:20 by 同仁堂教主
[文学芳草园] 风把牡丹吹跑了 +5 myrtle 2026-05-12 9/450 2026-05-15 15:27 by myrtle
[基金申请] 青C资助名额大幅增加! +11 西葫芦炒鸡蛋 2026-05-13 15/750 2026-05-15 14:36 by ambravo
[教师之家] 教学课件你会给同学吗 +8 硕士研究生吗 2026-05-13 8/400 2026-05-14 22:23 by 常规沥青
[考博] 26应届毕业生考博求助 +3 wo一定上岸 2026-05-13 3/150 2026-05-14 21:47 by 明海天涯
信息提示
请填处理意见