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cz4869

新虫 (初入文坛)

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[求助] 如何确定序列外显子和内含子？已有3人参与

我现在测得垂穗披碱草adh基因的序列，我想知道（1）如何确定该序列外显子和内含子？（2）在确定了序列内含子和外显子后如何确定序列所属基因组？

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1楼 2015-07-09 15:50:34

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wsad5213

银虫 (正式写手)

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【答案】应助回帖

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西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2015-07-10 21:04:00

在NCBI中查找这个物种的基因组，然后将你克隆的基因与其比对，你会发现有些比对上了，有些没有，没有比对上的就是内含子！因此可以知道内含子和外显子了

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2楼2015-07-09 16:09:35

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蜗牛不会飞

铁虫 (小有名气)

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★ ★
西门吹雪170: 金币+2, 鼓励回帖交流 2015-07-10 21:04:16

在www.genomic.ucsc.edu上搜，点击Gene Sorter，－－输入基因名称后确定－－description－－sequence－－Genomoc－－submit－－就可以看到全序列了，其中外显子是大写，内含子小写
我也是个新手，这是前段日子在论坛里学到的，这里是个学习的好地方，希望大家共同进步。NCBI上也可以分析。

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3楼2015-07-09 17:01:13

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