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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 分子生理 » 如何确定序列外显子和内含子？
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cz4869

新虫 (初入文坛)

[求助] 如何确定序列外显子和内含子？ 已有3人参与

我现在测得垂穗披碱草adh基因的序列，我想知道（1）如何确定该序列外显子和内含子？（2）在确定了序列内含子和外显子后如何确定序列所属基因组？
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1楼 2015-07-09 15:50:34
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hg30717580

木虫 (职业作家)

总经理

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
用ORFfind试试看咯
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突破自我，喜迎曙光
5楼2015-07-10 17:44:21
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wsad5213

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2015-07-10 21:04:00
在NCBI中查找这个物种的基因组，然后将你克隆的基因与其比对，你会发现有些比对上了，有些没有，没有比对上的就是内含子！因此可以知道内含子和外显子了
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2楼2015-07-09 16:09:35
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蜗牛不会飞

铁虫 (小有名气)
★ ★
西门吹雪170: 金币+2, 鼓励回帖交流 2015-07-10 21:04:16
在www.genomic.ucsc.edu上搜，点击Gene Sorter，－－输入基因名称后确定－－description－－sequence－－Genomoc－－submit－－就可以看到全序列了，其中外显子是大写，内含子小写
我也是个新手，这是前段日子在论坛里学到的，这里是个学习的好地方，希望大家共同进步。NCBI上也可以分析。
赞一下(2人) 回复此楼
3楼2015-07-09 17:01:13
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2015-07-10 21:04:29
确定基因属于哪个组的通过比对就可以知道。确定外显子内含子推荐用softberry网站的FGENESH在线工具。
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4楼2015-07-10 02:14:51
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